RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PRM7 423 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 CNTFRP26992 372 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 SLAQ13239 276 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 PET117Q6UWS5 81 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 DPF1Q92782 380 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 RNF114Q9Y508 228 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 LEPROTL1O95214 131 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 IGLV2-11P01706 119 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 LINC00614P0C842 121 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 CAMPP49913 170 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 LINC00310P59036 64 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 GNG5P63218 68 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 PRNTQ86SH4 94 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 TEX29Q8N6K0 151 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 LINC01006Q8NI28 216 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 USMG5Q96IX5 58 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 LINC00479Q96M42 142 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 METTL26Q96S19 204 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 ASCL2Q99929 193 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 PRO1933Q9H354 126 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-218ENST00000584243 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 TMEM189A5PLL7 270 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.21□□□□□ -1.42
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GGA3-218ENST00000584243 LYNX1P0DP58 116 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 CTRLP40313 264 aa6.21□□□□□ -1.42
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GGA3-218ENST00000584243 GAGE1Q13065 139 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 CNFNQ9BYD5 112 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 MYCBP2O75592 4640 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 LINC01549A6NIU2 74 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 K7EMI3 77 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 SPINK4O60575 86 aa6.2□□□□□ -1.42
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GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-48P01763 117 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 CTSGP08311 255 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 C3orf79P0CE67 100 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 MED14OSP0DP75 135 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 SLC35B1P78383 322 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 SPATA45Q537H7 98 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 FA2HQ7L5A8 372 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 TCF24Q7RTU0 167 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 NIT1Q86X76 327 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 ORMDL3Q8N138 153 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 Q8N9W7 124 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 GTSF1Q8WW33 167 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.2□□□□□ -1.42
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GGA3-218ENST00000584243 A0A0G2JLM5 398 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.19□□□□□ -1.42
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GGA3-218ENST00000584243 C15orf32Q32M92 178 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 PRR25Q96S07 402 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 BUB3O43684 328 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-218ENST00000584243 NUPR1O60356 82 aa6.18□□□□□ -1.42
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