RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567947.1

CBFB-208, Transcript of core-binding factor subunit beta, human

TSL 3

Gene CBFB, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBFB-208	ENST00000567947	IAPP	P10997	89 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	ATP5G2	Q06055	141 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	FAM27B	Q5VT28	67 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	TEN1	Q86WV5	123 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	ZNF799	Q96GE5	643 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	IMUP	Q9GZP8	106 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CBFB-208	ENST00000567947	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		3.78	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		3.78	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947		A0A1W2PPI3	338 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	IGLL5	B9A064	214 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	SYNGR3	O43761	229 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	BRI3	O95415	125 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	PATE4	P0C8F1	98 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	IFITM1	P13164	125 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	CRYGS	P22914	178 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	KIR2DS2	P43631	304 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	PCBD1	P61457	104 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	GAGE2B	Q13066	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	HES1	Q14469	280 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	RRN3P1	Q2M238	152 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	ETDB	Q3ZM63	59 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	ZNF876P	Q49A33	203 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	GAGE2E	Q4V326	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	MOB3B	Q86TA1	216 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947		Q8IYB0	196 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	MRAP	Q8TCY5	172 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	VPS13C	Q709C8	3753 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	C5orf49	A4QMS7	147 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	OOEP	A6NGQ2	149 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	LINC01546	A6NGU7	62 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	C15orf62	A8K5M9	175 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	GGTLC3	B5MD39	225 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	PRSS46	E5RG02	174 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	VCY	O14598	125 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	MOS	P00540	346 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	CRYGB	P07316	175 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	SCT	P09683	121 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	ZNF688	P0C7X2	276 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	BCL3	P20749	454 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	WFDC2	Q14508	124 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	TTC32	Q5I0X7	151 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	CEND1	Q8N111	149 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	RAB9B	Q9NP90	201 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	ZFHX3	Q15911	3703 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	HIGD1C	A8MV81	97 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	ATP5L	O75964	103 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	CNIH1	O95406	144 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	IGKV1D-12	P01611	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	C8orf88	P0DMB2	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CBFB-208	ENST00000567947	XG	P55808	180 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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