RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 TM4SF20Q53R12 229 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 VPS13CQ709C8 3753 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 ATP5G3P48201 142 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 TAS2R45P59539 299 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 TIGITQ495A1 244 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 PIFOQ8TCI5 191 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 ARPC1AQ92747 370 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 TRGV9Q99603 122 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 C20orf78Q9BR46 151 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CS-204ENST00000546621 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 I3L2K1 104 aa6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 K7EN84 100 aa6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 COX7A2P2O60397 106 aa6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 IGHV1-69P01742 117 aa6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 C8orf88P0DMB2 117 aa6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 NDPQ00604 133 aa6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 Q8N9W7 124 aa6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 ZNF503Q96F45 646 aa6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 DUX5Q96PT3 197 aa6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 MDFICQ9P1T7 246 aa6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 TACC2O95359 2948 aa6.09□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 FLNCQ14315 2725 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 CCDC179H3BU77 68 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 K7EIM0 57 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 MSMBP08118 114 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 IFITM1P13164 125 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 SLC25A16P16260 332 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 ASIPP42127 132 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 MED13LQ71F56 2210 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 B4DSR2 109 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 J3KT08 172 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 HLA-DRB4P13762 266 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 MORN5Q5VZ52 161 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 PATE2Q6UY27 113 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 PRELID3AQ96N28 172 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 ORM2P19652 201 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 GAGE2BQ13066 116 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 GAGE2EQ4V326 116 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 RAB37Q96AX2 223 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 PAXXQ9BUH6 204 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 A0A1B0GWB2 263 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 IGKV1-17P01599 117 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 GCSHP23434 173 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 TAL2Q16559 108 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 TTC32Q5I0X7 151 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-204ENST00000546621 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.05□□□□□ -1.44
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