RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 SLC25A20O43772 301 aa5.1□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 IGLV2-14P01704 120 aa5.1□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 HELZP42694 1942 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.1□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.1□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 SHROOM2Q13796 1616 aa5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 DISP1Q96F81 1524 aa5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 SNRPGP15A8MWD9 76 aa5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 F2Z2F3 143 aa5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 CCL5P13501 91 aa5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 RHOHQ15669 191 aa5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PDCD4-211ENST00000498367 SCN9AQ15858 1988 aa5.09□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 ATAD5Q96QE3 1844 aa5.09□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 A6NIN4 97 aa5.08□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 SH2D1AO60880 128 aa5.08□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 IGLV3-25P01717 112 aa5.08□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 PROK1P58294 105 aa5.08□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 IGFBP7Q16270 282 aa5.08□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.08□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.08□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 VOPP1Q96AW1 172 aa5.08□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.08□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 V9GYH0 126 aa5.08□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 TET3O43151 1660 aa5.08□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 UGGT1Q9NYU2 1555 aa5.08□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 RGPD5Q99666 1765 aa5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PQD3 144 aa5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 ASAH2BP0C7U1 165 aa5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 SLC48A1Q6P1K1 146 aa5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 Q6ZQT7 251 aa5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 TVP23CQ96ET8 276 aa5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.07□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa5.06□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 hDV103S1A0JD37 113 aa5.06□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 A6NED7 52 aa5.06□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV1-46P01743 117 aa5.06□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 LINC00643Q86TS7 51 aa5.06□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 RPRMLQ8N4K4 120 aa5.06□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF525Q8N782 197 aa5.06□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 UNC13BO14795 1591 aa5.06□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 PATJQ8NI35 1801 aa5.06□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 RGPD1P0DJD0 1748 aa5.06□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 PTPRBP23467 1997 aa5.05□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.05□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 SOCS2O14508 198 aa5.05□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 UBE2G1P62253 170 aa5.05□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF117Q03924 483 aa5.05□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 IGFL3Q6UXB1 125 aa5.05□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.05□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.05□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM141Q96I45 108 aa5.05□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 SCRT1Q9BWW7 348 aa5.05□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 NWD2Q9ULI1 1742 aa5.05□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.04□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.04□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 LY6HO94772 140 aa5.04□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 CGB3P0DN86 165 aa5.04□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 CGB7P0DN87 165 aa5.04□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 CD24P25063 80 aa5.04□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 LYZP61626 148 aa5.04□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 PYDC2Q56P42 97 aa5.04□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 DYNAPQ8N1N2 210 aa5.04□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF580Q9UK33 172 aa5.04□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 ITSN2Q9NZM3 1697 aa5.04□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 PCSK5Q92824 1860 aa5.04□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 RGPD2P0DJD1 1756 aa5.04□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa5.03□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 HMGXB3Q12766 1538 aa5.03□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 RALGAPBQ86X10 1494 aa5.03□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 GNRH2O43555 120 aa5.03□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 NOVP48745 357 aa5.03□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF79Q15937 498 aa5.03□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.03□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 Q8N976 141 aa5.03□□□□□ -1.6
PDCD4-211ENST00000498367 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms