RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489333.1

GABRE-210, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit, humanhuman

TSL 2

Gene GABRE, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRE-210ENST00000489333 COX11Q9Y6N1 276 aa6.71□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 ZANQ9Y493 2812 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 H3BTX0 84 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 NDUFS8O00217 210 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 TCF21O43680 179 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 BUB3O43684 328 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 IGLC6P0CF74 106 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 COX8AP10176 69 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 CKS2P33552 79 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 LCN12Q6JVE5 192 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 CUBNO60494 3623 aa6.7□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 OR2T8A6NH00 312 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 PRSS47A8MTI9 375 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 OVOL3O00110 214 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 NPFFO15130 113 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 CD5LO43866 347 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 CRLF1O75462 422 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 PPP1R17O96001 155 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 G0S2P27469 103 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 CRIP1P50238 77 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 RHOGP84095 191 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 ATP5G2Q06055 141 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 UBE2V1Q13404 147 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 TWIST1Q15672 202 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 C15orf32Q32M92 178 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 USMG5Q96IX5 58 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 C17orf77Q96MU5 243 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.69□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 A6NDN8 102 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 D6R8Y8 96 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 M0R3E3 92 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 ATP5LO75964 103 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 MED14OSP0DP75 135 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 ZNF138P52744 262 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 PTTG1IPP53801 180 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 KLRD1Q13241 179 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 STPG4Q8N801 248 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 TPPP3Q9BW30 176 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 ZNF580Q9UK33 172 aa6.68□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 OVOL1O14753 267 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 NDUFS7O75251 213 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 IGHV4-39P01824 125 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 ORM1P02763 201 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 CLEC3BP05452 202 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 HLA-DRB4P13762 266 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 GPR183P32249 361 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 SAA4P35542 130 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 NDPQ00604 133 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 ATOH7Q8N100 152 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 MRAP2Q96G30 205 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 LINC00477Q96M19 166 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 C8orf49Q96NF6 230 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 U3KQE9 123 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.67□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 A0A0G2JLM5 398 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 NDUFA4O00483 81 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 PLXNB1O43157 2135 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 IGF1P05019 195 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 GATA3P23771 443 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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GABRE-210ENST00000489333 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 DLX1P56177 255 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 LMO4P61968 165 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 KIR3DS1Q14943 382 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 COL6A5A8TX70 2615 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 FBN3Q75N90 2809 aa6.66□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.65□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 K7EP13 123 aa6.65□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 ATP6V0E1O15342 81 aa6.65□□□□□ -1.34
GABRE-210ENST00000489333 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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