RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 HIF1ANQ9NWT6 349 aa12.73□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GW15 77 aa12.72□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 EFNA4P52798 201 aa12.72□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ODF1Q14990 250 aa12.72□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 OR11H12B2RN74 326 aa12.72□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 E9PLD3 99 aa12.72□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 OR11H1Q8NG94 326 aa12.72□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 OR11H2Q8NH07 326 aa12.72□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 VKORC1Q9BQB6 163 aa12.72□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SMPXQ9UHP9 88 aa12.72□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SHISA9B4DS77 424 aa12.72□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 Q6AWC8 147 aa12.72□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ONECUT1Q9UBC0 465 aa12.72□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa12.71□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 C3orf36Q3SXR2 165 aa12.71□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa12.71□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa12.71□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01549A6NIU2 74 aa12.71□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TNFRSF6BO95407 300 aa12.71□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CD3EP07766 207 aa12.71□□□□□ -0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV19A0A075B6N1 114 aa12.71□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV1-8P0DP01 117 aa12.71□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RRN3P1Q2M238 152 aa12.7□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PRSS29PA6NIE9 313 aa12.7□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF785A8K8V0 405 aa12.7□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PRTN3P24158 256 aa12.7□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA25Q9BR10 227 aa12.7□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa12.69□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 FOXI1Q12951 378 aa12.69□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa12.68□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CCL21O00585 134 aa12.68□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 HLA-DMBP28068 263 aa12.68□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 HES1Q14469 280 aa12.68□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 HHLA3Q9XRX5 114 aa12.68□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa12.68□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CDSNQ15517 529 aa12.68□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 EMP1P54849 157 aa12.68□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SCGB2A1O75556 95 aa12.67□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 HLA-DRB4P13762 266 aa12.67□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RNF125Q96EQ8 232 aa12.67□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa12.67□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ZFP2Q6ZN57 461 aa12.67□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa12.67□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SPRY2O43597 315 aa12.67□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 XGP55808 180 aa12.67□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa12.67□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV2-23P01705 113 aa12.66□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM155Q4W5P6 130 aa12.66□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa12.66□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TEX29Q8N6K0 151 aa12.66□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RAXQ9Y2V3 346 aa12.66□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ATP5LO75964 103 aa12.66□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa12.66□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa12.65□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00574Q9H8X3 128 aa12.65□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 HIGD1BQ9P298 99 aa12.65□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 KLRD1Q13241 179 aa12.65□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TM2D2Q9BX73 214 aa12.65□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RPL7P18124 248 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ERCC8Q13216 396 aa12.65□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R27Q86WC6 154 aa12.65□□□□□ -0.38
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa12.64□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV1-17P01599 117 aa12.64□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 KIR2DL4Q99706 377 aa12.64□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF815PA8K554 130 aa12.64□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 NBL1P41271 181 aa12.64□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SPANXN1Q5VSR9 72 aa12.64□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZUT4 128 aa12.64□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa12.64□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa12.63□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ZFAND6Q6FIF0 208 aa12.63□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa12.63□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01548A6NM66 108 aa12.63□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF493Q6ZR52 646 aa12.63□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa12.62□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 K7ENP7 123 aa12.62□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SCGB3A1Q96QR1 104 aa12.62□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SIGLEC9Q9Y336 463 aa12.62□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 CREBBPQ92793 2442 aa12.62□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 B9A039 149 aa12.62□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 NFE4Q86UQ8 179 aa12.62□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 DTX2Q86UW9 622 aa12.62□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 PRR25Q96S07 402 aa12.62□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 DLX6P56179 175 aa12.61□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 Q1RN00 199 aa12.61□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM20Q8N5G0 67 aa12.61□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa12.61□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TTC32Q5I0X7 151 aa12.61□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TIMM23O14925 209 aa12.6□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa12.6□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TRGV3P03979 118 aa12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 174 ms