RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 C2orf50Q96LR7 162 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 ZNF492Q9P255 531 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 TCRBP04435 133 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 GCSHP23434 173 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 ZNF138P52744 262 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 NHLH2Q02577 135 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 FXYD5Q96DB9 178 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 NUDT15Q9NV35 164 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 PRELID1Q9Y255 219 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 LYRM1O43325 122 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 SIX6O95475 246 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 SRIP30626 198 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 S100A11P31949 105 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 IL15RAQ13261 267 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 PDE6HQ13956 83 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 NFE4Q86UQ8 179 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 NAGKQ9UJ70 344 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 GNRH2O43555 120 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 CRYGDP07320 174 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 RANP62826 216 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 STX12Q86Y82 276 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 PAXXQ9BUH6 204 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 OR51M1Q9H341 326 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 Q9HAA7 133 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.52□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 NMBP08949 121 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 EVI2AP22794 236 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 HBG1P69891 147 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 HBG2P69892 147 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 ZNF266Q14584 549 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 OR7C2O60412 319 aa7.51□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 SLAQ13239 276 aa7.51□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa7.51□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 Q8N3U1 123 aa7.51□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 HYLS1Q96M11 299 aa7.51□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 F6UZH7 168 aa7.5□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 H0YIZ8 118 aa7.5□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-30P01768 117 aa7.5□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-33P01772 117 aa7.5□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.5□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.5□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 WFDC2Q14508 124 aa7.5□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 ATP6V1FQ16864 119 aa7.5□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.5□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.5□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 RASL10AQ92737 203 aa7.5□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.49□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 DIRC3C9JPN6 131 aa7.49□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 FAM229AH3BQW9 127 aa7.49□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 PSCAO43653 123 aa7.49□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 Q6AWC8 147 aa7.49□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZSN1 163 aa7.49□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.49□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 TVP23CQ96ET8 276 aa7.49□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.48□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.48□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 C9JCJ5 164 aa7.48□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 LECT2O14960 151 aa7.48□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 CSN1S1P47710 185 aa7.48□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 PPT1P50897 306 aa7.48□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 GNG5P63218 68 aa7.48□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.48□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 LINC01620Q4KN68 170 aa7.48□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.48□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.48□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 SGK494Q96LW2 274 aa7.48□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.48□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.47□□□□□ -1.21
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