RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362804.1

RNU6-862P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 862, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-862P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-862P-201ENST00000362804 HSPB11Q9Y547 144 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 MPC1Q9Y5U8 109 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 PLXNA2O75051 1894 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 ABCA1O95477 2261 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 FAM135BQ49AJ0 1406 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 LOC285556D6RIA3 1793 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 DLEC1Q9Y238 1755 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 A0A1W2PPB8 328 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 A0A1W2PRS3 328 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 KIR3DP1A8MWS1 328 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 K7EIL1 84 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 GYPBP06028 91 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 CRYGSP22914 178 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 RPL22P35268 128 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 FXYD4P59646 89 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 HRCT1Q6UXD1 115 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 TEX29Q8N6K0 151 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 TMEM35BQ8NCS4 154 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 OR8J3Q8NGG0 315 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 OR51A4Q8NGJ6 313 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 CCDC115Q96NT0 180 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 LIMD2Q9BT23 127 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 TAF9BQ9HBM6 251 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 JPT1Q9UK76 154 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 MYO7AQ13402 2215 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 MED13LQ71F56 2210 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 KCPQ6ZWJ8 1503 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 FGD6Q6ZV73 1430 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP24Q9UPU5 2620 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 TENM3Q9P273 2699 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 MYH6P13533 1939 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 MED23Q9ULK4 1368 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 PRORSD1PA6NEY8 169 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 NUPR2A6NF83 97 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 J3KT08 172 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 UQCRQO14949 82 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 EDF1O60869 148 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 SPINT3P49223 89 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 CAV3P56539 151 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 PSPHP78330 225 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 Q86TA4 180 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 NAT14Q8WUY8 206 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 NABP2Q9BQ15 211 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 SMIM7Q9BQ49 75 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 CBLN4Q9NTU7 201 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 ABCA4P78363 2273 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 WDR97A6NE52 1622 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 KDM5CP41229 1560 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 TMEM189A5PLL7 270 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 H0YJX3 145 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 DPM2O94777 84 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 IGF2P01344 180 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 HBDP02042 147 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 RPL7P18124 248 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 CKS2P33552 79 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 ZNF137PP52743 207 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 RPS28P62857 69 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 BLCAPP62952 87 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 SPINK13Q1W4C9 94 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 XAF1Q6GPH4 301 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 C10orf99Q6UWK7 81 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 IDO2Q6ZQW0 420 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 ARL17AQ8IVW1 177 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 OR8I2Q8N0Y5 310 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 BRK1Q8WUW1 75 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 CCL19Q99731 98 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 C10orf95Q9H7T3 257 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 GINS2Q9Y248 185 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 NDUFAF1Q9Y375 327 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 RREB1Q92766 1687 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 DSPPQ9NZW4 1301 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 A0A1B0GX51 115 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 HIGD1CA8MV81 97 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 M0QZK8 103 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 SLC25A4P12235 298 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 EVI2AP22794 236 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 KDELR1P24390 212 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-862P-201ENST00000362804 SDC4P31431 198 aa0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms