RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 UBE2D3P61077 147 aa16.48■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 UBE2D2P62837 147 aa16.48■□□□□ 0.23
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ODC1-201ENST00000234111 A6NJY4 79 aa16.48■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa16.48■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 LYPD2Q6UXB3 125 aa16.48■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
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ODC1-201ENST00000234111 GAGE7O76087 117 aa16.35■□□□□ 0.21
ODC1-201ENST00000234111 IGHV3-23P01764 117 aa16.35■□□□□ 0.21
ODC1-201ENST00000234111 GAGE12FP0CL80 117 aa16.35■□□□□ 0.21
ODC1-201ENST00000234111 GAGE12GP0CL81 117 aa16.35■□□□□ 0.21
ODC1-201ENST00000234111 GAGE12IP0CL82 117 aa16.35■□□□□ 0.21
ODC1-201ENST00000234111 RPL32P62910 135 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ODC1-201ENST00000234111 GAGE4Q13068 117 aa16.35■□□□□ 0.21
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