RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 IGKCP01834 107 aa15.99■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 PRSS1P07477 247 aa15.99■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa15.99■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 SH2D6Q7Z4S9 175 aa15.99■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa15.99■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 SIGMAR1Q99720 223 aa15.99■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 HLA-DMBP28068 263 aa15.98■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 E9PLD3 99 aa15.98■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 FCER1GP30273 86 aa15.98■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa15.98■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 ARPC1AQ92747 370 aa15.98■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 GAGE12HA6NDE8 117 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 THBDP07204 575 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 COX7A1P24310 79 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 S100A7AQ86SG5 101 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 TM2D2Q9BX73 214 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 CHD8Q9HCK8 2581 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 BSNQ9UPA5 3926 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 IGLL5B9A064 214 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 H3BMG7 143 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 CNIH1O95406 144 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 AMTNQ6UX39 209 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 TMEM158Q8WZ71 300 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 TNFRSF14Q92956 283 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 TMEM8BA6NDV4 472 aa15.96■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 LINC01546A6NGU7 62 aa15.96■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 TNFRSF6BO95407 300 aa15.96■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 BSPH1Q075Z2 132 aa15.96■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 TMEM108Q6UXF1 575 aa15.96■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 MSRB2Q9Y3D2 182 aa15.96■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa15.96■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 PDE6HQ13956 83 aa15.96■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 TPRP12270 2363 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 PPIFP30405 207 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 GFRALQ6UXV0 394 aa15.95■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 SHISA9B4DS77 424 aa15.95■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 ETDBQ3ZM63 59 aa15.95■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 FOXI2Q6ZQN5 318 aa15.95■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 COX8CQ7Z4L0 72 aa15.95■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 PCNX1Q96RV3 2341 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 TRAV40A0A0B4J280 105 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 TMEM190Q8WZ59 177 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 TMEM160Q9NX00 188 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 IGHG4P01861 327 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 INSL3P51460 131 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 ZNF479Q96JC4 524 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 DPM2O94777 84 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 ORM1P02763 201 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 SCGB1A1P11684 91 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 CLUHP3Q96NS8 147 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 SMPXQ9UHP9 88 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 VSTM5A8MXK1 200 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 PRRG2O14669 202 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 RPEQ96AT9 228 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 KAAG1Q9UBP8 84 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 F8W735 103 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 IGHV3-23P01764 117 aa15.92■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 F8W1H4 67 aa15.91■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 C12orf74Q32Q52 190 aa15.91■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 SPATA25Q9BR10 227 aa15.91■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa15.91■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa15.9■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 TIMM23O14925 209 aa15.9■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 CNFNQ9BYD5 112 aa15.9■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa15.9■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 ERCC8Q13216 396 aa15.9■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PMS1-222ENST00000639501 TRGV3P03979 118 aa15.89■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 DTX2Q86UW9 622 aa15.89■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 PRO0461Q9UI25 63 aa15.89■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 LYNX1G3V0Z9 82 aa15.89■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 LYNX1P0DP58 116 aa15.89■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 BMI1P35226 326 aa15.89■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 ATP5G2Q06055 141 aa15.89■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 LCNL1Q6ZST4 164 aa15.89■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 FANCD2OSQ96PS1 177 aa15.89■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 ATP6V0BQ99437 205 aa15.89■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 DCHS2Q6V1P9 2916 aa15.89■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa15.88■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 ATP5LO75964 103 aa15.88■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 DYNAPQ8N1N2 210 aa15.87■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 CACNA1AO00555 2505 aa15.87■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 SVEP1Q4LDE5 3571 aa15.87■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 PRAC2D3DTV9 90 aa15.87■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 Q8N8P6 123 aa15.87■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 RAB1BQ9H0U4 201 aa15.87■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 LY6LH3BQJ8 138 aa15.86■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 HLA-DRB4P13762 266 aa15.86■□□□□ 0.13
PMS1-222ENST00000639501 EFNA4P52798 201 aa15.86■□□□□ 0.13
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