RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630804.2

SPTAN1-222, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SPTAN1, Length 7,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-222ENST00000630804 SPG11Q96JI7 2443 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 COL4A1P02462 1669 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 WBP1Q96G27 269 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 MPZP25189 248 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 FAM223BA6NKX1 122 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 HLA-DRB4P13762 266 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 COLCA2A8K830 154 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 H3BMG7 143 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 CFHR2P36980 270 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 CEND1Q8N111 149 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 H3BUX3 64 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 LYNX1P0DP58 116 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 CSRP3P50461 194 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 APOC4P55056 127 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 TTC28Q96AY4 2481 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 XCL2Q9UBD3 114 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 SHISA3A0PJX4 238 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 ACYP1P07311 99 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 PSMB8P28062 276 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 A0A1B0GTI1 187 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 A0A1W2PPM0 123 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 J3KT08 172 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 DEFB131AP59861 70 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 BUB3O43684 328 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 GATA3P23771 443 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 ATOX1O00244 68 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 CASC2Q6XLA1 102 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 HERVK_113P63121 156 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 RNF5Q99942 180 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF329Q86UD4 541 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF503Q96F45 646 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 TEX22C9J3V5 150 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 GNLYP22749 145 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 M0R1W7 72 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGHV1-46P01743 117 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 NREPQ16612 68 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 SLX1AQ9BQ83 275 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 NOTCH2Q04721 2471 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 TSC2P49815 1807 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 K7EP34 96 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 PTPN13Q12923 2485 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 PYY3Q5JQD4 70 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 U3KQE9 123 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 WFDC1Q9HC57 220 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGLC2P0DOY2 106 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGLC3P0DOY3 106 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 RNF183Q96D59 192 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-222ENST00000630804 SRRM5B3KS81 715 aa6.66□□□□□ -1.34
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