RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa10.31□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 COL6A6A6NMZ7 2263 aa10.31□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 A0A087X0K7 114 aa10.3□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 G3V318 75 aa10.3□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 RHOGP84095 191 aa10.3□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 S100A7AQ86SG5 101 aa10.3□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 ORMDL3Q8N138 153 aa10.3□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa10.3□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 AKAP6Q13023 2319 aa10.3□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 BUB3O43684 328 aa10.3□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 SAA4P35542 130 aa10.3□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD39Q53RE8 183 aa10.3□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 MS4A6AQ9H2W1 248 aa10.3□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF738Q8NE65 137 aa10.29□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 OR8A1Q8NGG7 326 aa10.29□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 CACNA1BQ00975 2339 aa10.29□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 CLEC3BP05452 202 aa10.29□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 COX8AP10176 69 aa10.29□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2V1Q13404 147 aa10.29□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 TWIST1Q15672 202 aa10.29□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 IL17RELQ6ZVW7 336 aa10.29□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 CNFNQ9BYD5 112 aa10.29□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 C11orf21Q9P2W6 132 aa10.29□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa10.29□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 SNAI2O43623 268 aa10.29□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2E1P51965 193 aa10.29□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa10.28□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa10.28□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 HSBP1L1C9JCN9 74 aa10.28□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 Q6ZQT7 251 aa10.28□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 LMO4P61968 165 aa10.28□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 PTTG1IPP53801 180 aa10.28□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
C9orf170-201ENST00000623052 PRSS57Q6UWY2 283 aa10.27□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 CLEC19AQ6UXS0 136 aa10.27□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB125Q8N687 156 aa10.27□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa10.27□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 PPIFP30405 207 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 LINC01559Q495D7 138 aa10.27□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.27□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 UBTD1Q9HAC8 227 aa10.27□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 CACNG7P62955 275 aa10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 ORM1P02763 201 aa10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 CKS2P33552 79 aa10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 BMI1P35226 326 aa10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 TCTAP57738 103 aa10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 LINC01546A6NGU7 62 aa10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 HBDP02042 147 aa10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 UCNP55089 124 aa10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 RPS20P60866 119 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 LGALS9BQ3B8N2 356 aa10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 LGALS9CQ6DKI2 356 aa10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 WFDC3Q8IUB2 231 aa10.26□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 C5orf56Q8N8D9 126 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 C19orf84I3L1E1 186 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 RBAKDNA6NC62 111 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 FABP5P3A8MUU1 101 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 C19orf54Q5BKX5 351 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 TRGV3P03979 118 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 EFNA4P52798 201 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM219Q86XT9 240 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 SPTBN4Q9H254 2564 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 EVI2AP22794 236 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 NPFFO15130 113 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 SCGB2A1O75556 95 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 LY6DQ14210 128 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 DKK2Q9UBU2 259 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 U3KQE9 123 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 CHD8Q9HCK8 2581 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 C12orf54Q6X4T0 127 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 C8orf86Q6ZUL3 223 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 DPF1Q92782 380 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 IFI27L1Q96BM0 104 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 PRR9Q5T870 116 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00527Q9UJ94 153 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 CBY3A6NI87 242 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 UQCRFS1P47985 274 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 NHLH1Q02575 133 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 BOD1L2Q8IYS8 172 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 PIFOQ8TCI5 191 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 SLC50A1Q9BRV3 221 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 GOSR1O95249 250 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 TNFRSF6BO95407 300 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 C20orf173Q96LM9 149 aa10.21□□□□□ -0.77
C9orf170-201ENST00000623052 C18orf15Q96N68 181 aa10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms