RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 K7EQM0 130 aa18.68■□□□□ 0.58
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP18.65■□□□□ 0.58
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa18.65■□□□□ 0.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MPV17L2Q567V2 206 aa18.65■□□□□ 0.58
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AP5S1Q9NUS5 200 aa18.64■□□□□ 0.57
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTPN13Q12923 2485 aa18.64■□□□□ 0.57
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MS4A6AQ9H2W1 248 aa18.61■□□□□ 0.57
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CBY1Q9Y3M2 126 aa18.58■□□□□ 0.56
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa18.55■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM189A5PLL7 270 aa18.55■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 D6R8Y8 96 aa18.55■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BLCAPP62952 87 aa18.55■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM104BQ5XKR9 115 aa18.55■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa18.55■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa18.55■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL7P18124 248 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MUC21A0A140T8X8 626 aa18.54■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRGV3P03979 118 aa18.54■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PSG9Q00887 426 aa18.54■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MUC21Q5SSG8 566 aa18.54■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C12orf54Q6X4T0 127 aa18.54■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AMN1Q8IY45 258 aa18.54■□□□□ 0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
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