RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 FOXE3Q13461 319 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf85Q96MD7 179 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TM2D1Q9BX74 207 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFC1O43677 76 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TM2D2Q9BX73 214 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD36A6QL64 1941 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 NINQ8N4C6 2090 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 RBAKDNA6NC62 111 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 ARL14EPLP0DKL9 152 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 CCL1P22362 96 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 ORMDL3Q8N138 153 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 SERP2Q8N6R1 65 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 APOC4P55056 127 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 ESPL1Q14674 2120 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFA3O95167 84 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 SHISA3A0PJX4 238 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 H3BUX3 64 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 OCC1Q8TAD7 63 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GUT8 65 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 J3QQQ9 107 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 GHRHP01286 108 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF525Q8N782 197 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 DPH3Q96FX2 82 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01590Q5TEZ4 76 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV1-8P0DP01 117 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 YPEL4Q96NS1 127 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TIMM17AQ99595 171 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 VWA8A3KMH1 1905 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 HIGD1CA8MV81 97 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 H3BUA1 57 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 VCYO14598 125 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 PSPNO60542 156 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 NOTCH2Q04721 2471 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 E9PLD3 99 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 SOCS3O14543 225 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 C12orf77C9JDV5 145 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 ICE1Q9Y2F5 2266 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 VWC2LB2RUY7 222 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 F2Z2F3 143 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 PEX7O00628 323 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2AP49459 152 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 GTSF1Q8WW33 167 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 CARD19Q96LW7 228 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01587Q99440 93 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM14DPA8MWL7 114 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 INAFM1C9JVW0 142 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 FMC1Q96HJ9 113 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TRGV9Q99603 122 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf83Q53S99 150 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 UBL5Q9BZL1 73 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 ACACBO00763 2458 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 CLPSP04118 112 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 MDFICQ9P1T7 246 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 FAM215AQ9Y5M1 114 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01619G3V211 115 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 LY6G6DO95868 133 aa5.04□□□□□ -1.6
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