RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF292	O60281	2723 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ODF3B	A8MYP8	253 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		H3BUT2	72 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	TIMM23	O14925	209 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	IL4	P05112	153 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	EVI2A	P22794	236 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	COX7A1	P24310	79 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	FCER1G	P30273	86 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	KLK9	Q2XQG4	91 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	S100A7A	Q86SG5	101 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB123	Q8N688	67 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		Q8N6K4	173 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RPE	Q96AT9	228 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RAX2	Q96IS3	184 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	C18orf15	Q96N68	181 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	VGLL1	Q99990	258 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	TPPP3	Q9BW30	176 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PRSS47	A8MTI9	375 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		B9A039	149 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM238	C9JI98	176 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	NBR2	O15453	112 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	GAS8-AS1	O95177	125 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	CNIH1	O95406	144 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SMIM17	P0DL12	118 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	CKS2	P33552	79 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	FXYD2	P54710	66 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	MFAP4	P55083	255 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RIPPLY3	P57055	190 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	FXYD7	P58549	80 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	NDP	Q00604	133 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PLGLA	Q15195	96 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SYT8	Q8NBV8	401 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	TM2D2	Q9BX73	214 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SMPX	Q9UHP9	88 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	PRAC2	D3DTV9	90 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746		E9PLD3	99 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC01619	G3V211	115 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	TNFRSF6B	O95407	300 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	CTSG	P08311	255 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	SMIM13	P0DJ93	91 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	LYNX1	P0DP58	116 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	FABP2	P12104	132 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	BMI1	P35226	326 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	LEP	P41159	167 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	NMU	P48645	174 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	TWIST1	Q15672	202 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746		Q8N8P6	123 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	NRAC	Q8N912	160 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746		Q8NA96	180 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746		Q8TAT8	98 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	AP1S3	Q96PC3	154 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	DPM3	Q9P2X0	92 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		3.83	□□□□□ -1.8

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