RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399336.8

NOMO3-202, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 4,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-202ENST00000399336 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NOMO3-202ENST00000399336 THAP8Q8NA92 274 aa14.59□□□□□ -0.07
NOMO3-202ENST00000399336 EMP1P54849 157 aa14.58□□□□□ -0.07
NOMO3-202ENST00000399336 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
NOMO3-202ENST00000399336 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
NOMO3-202ENST00000399336 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.58□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.58□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.57□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF492Q9P255 531 aa14.57□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa14.57□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 PDE6HQ13956 83 aa14.57□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.57□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 PSMB11A5LHX3 300 aa14.57□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 LRP4O75096 1905 aa14.57□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 DPM2O94777 84 aa14.57□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF688P0C7X2 276 aa14.57□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 DSCAML1Q8TD84 2053 aa14.57□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF479Q96JC4 524 aa14.57□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF491Q8N8L2 437 aa14.56□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 HCFC1P51610 2035 aa14.56□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 TCF15Q12870 199 aa14.56□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 SEC11AP67812 179 aa14.56□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 RAX2Q96IS3 184 aa14.55□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 GFRA4Q9GZZ7 299 aa14.55□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 A0A1W2PRX2 142 aa14.55□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 KIR3DS1Q14943 382 aa14.55□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 PSMG4Q5JS54 123 aa14.55□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 MS4A6AQ9H2W1 248 aa14.55□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 COX6CP09669 75 aa14.55□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 CT83Q5H943 113 aa14.55□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.55□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.54□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.54□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.54□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 NCKAP5O14513 1909 aa14.54□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 PPP1R17O96001 155 aa14.54□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 IGKCP01834 107 aa14.54□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 HLA-DMBP28068 263 aa14.54□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 HSD52Q0P140 79 aa14.54□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.54□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 GAGE1Q13065 139 aa14.53□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.53□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.53□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 PRR25Q96S07 402 aa14.53□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 FAM231BA6NCW3 169 aa14.53□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 FCN3O75636 299 aa14.53□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 IGKV1-17P01599 117 aa14.53□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.53□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa14.52□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 H3BRN7 92 aa14.52□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 CCL25O15444 150 aa14.52□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.52□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 OVOL3O00110 214 aa14.52□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 UBE2E1P51965 193 aa14.52□□□□□ -0.08
NOMO3-202ENST00000399336 PAX1P15863 534 aa14.52□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.52□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 DUX3Q96PT4 197 aa14.52□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 CGB3P0DN86 165 aa14.52□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 CGB7P0DN87 165 aa14.52□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 OVOL1O14753 267 aa14.51□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 CR1LQ2VPA4 569 aa14.51□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 FAM104BQ5XKR9 115 aa14.51□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 IL17RELQ6ZVW7 336 aa14.51□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 VGLL1Q99990 258 aa14.51□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 CYSLTR1Q9Y271 337 aa14.51□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.51□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa14.51□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.51□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa14.5□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 LAGE3Q14657 143 aa14.5□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.5□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 TEX43Q6ZNM6 134 aa14.5□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.5□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.5□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.49□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 TNFRSF6BO95407 300 aa14.49□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 ORMDL2Q53FV1 153 aa14.49□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 HIVEP2P31629 2446 aa14.49□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 LTAP01374 205 aa14.48□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 NBL1P41271 181 aa14.48□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 RRN3P1Q2M238 152 aa14.48□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 OR5A1Q8NGJ0 315 aa14.48□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 SNCGO76070 127 aa14.48□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.48□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 CD5LO43866 347 aa14.48□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 ESDP10768 282 aa14.48□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.48□□□□□ -0.09
NOMO3-202ENST00000399336 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms