RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 RRN3P1Q2M238 152 aa14.78□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 TTC9CQ8N5M4 171 aa14.78□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 ORM1P02763 201 aa14.77□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.77□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.77□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 NDUFA3O95167 84 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 SYT8Q8NBV8 401 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF502Q8TBZ5 544 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 CCL17Q92583 94 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 SHISA9B4DS77 424 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 PLGLAQ15195 96 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 LINC00311Q8N616 119 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 PRR25Q96S07 402 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 CRYGBP07316 175 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 PRSS33Q8NF86 280 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 NDUFB3O43676 98 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 HLA-DMBP28068 263 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 K7EIM0 57 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 CTSZQ9UBR2 303 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 IGLC6P0CF74 106 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF575Q86XF7 245 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 GLMPQ8WWB7 406 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 VSTM5A8MXK1 200 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 MT-ATP8P03928 68 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 C8orf86Q6ZUL3 223 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 ATP5LO75964 103 aa14.73□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 CNIH1O95406 144 aa14.73□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 SPINK8P0C7L1 97 aa14.73□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 IGHV1-8P0DP01 117 aa14.73□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 LOXP28300 417 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 FAM27E3Q08E93 113 aa14.73□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 CDIP1Q9H305 208 aa14.73□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 EFNA4P52798 201 aa14.72□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 FOXI1Q12951 378 aa14.72□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.72□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 CYSLTR1Q9Y271 337 aa14.72□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 FHL3Q13643 280 aa14.72□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.72□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 CEACAM4O75871 244 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 PSMG4Q5JS54 123 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 GATA3P23771 443 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 DLX6P56179 175 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 NFE4Q86UQ8 179 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 PTH2Q96A98 100 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 RPEQ96AT9 228 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.71□□□□□ -0.05
PRPF39-201ENST00000355765 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.71□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa14.71□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 DTX2Q86UW9 622 aa14.71□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 CD40P25942 277 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 TRGV3P03979 118 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.7□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 LINC01546A6NGU7 62 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 IGHV3-23P01764 117 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 THBDP07204 575 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 COX7A1P24310 79 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 TAL2Q16559 108 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 LAMA5O15230 3695 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 ERCC8Q13216 396 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 Q8N8P6 123 aa14.69□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 LINC01548A6NM66 108 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 C17orf100A8MU93 164 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM178BH3BS89 294 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 KLK15Q9H2R5 256 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 XGP55808 180 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 POLEQ07864 2286 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 PSMB2P49721 201 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 HLA-DRB4P13762 266 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 PDE6HQ13956 83 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 GFRALQ6UXV0 394 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 ARL17AQ8IVW1 177 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 A0A087WX48 190 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 RNF183Q96D59 192 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF39-201ENST00000355765 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms