RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 CCL20P78556 96 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 ICAM4Q14773 271 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 PSG3Q16557 428 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 GNG13Q9P2W3 67 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 SORL1Q92673 2214 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PRE2 83 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 PGPA6NDG6 321 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 FAM74A7A6NL05 159 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 KNCNA6PVL3 124 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 GGTLC3B5MD39 225 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 M0R3E3 92 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 PAGE4O60829 102 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 PPT1P50897 306 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 DEFB1P60022 68 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 RAB14P61106 215 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 CST9LP1Q5W188 147 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 Q8N1Y9 231 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 DEFB125Q8N687 156 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 MANBALQ9NQG1 85 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 OTORQ9NRC9 128 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 PRELID1Q9Y255 219 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 PRAC2D3DTV9 90 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 F6UB75 175 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 IFNA1P01562 189 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 NMBP08949 121 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 CSN1S1P47710 185 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 GNG5P63218 68 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0J9YX75 114 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 C11orf94C9JXX5 98 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-DRB4P13762 266 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 ATP5G3P48201 142 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 HAGHQ16775 308 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 STHQ8IWL8 128 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 TUBA4BQ9H853 241 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 NOTCH1P46531 2555 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 DIRC3C9JPN6 131 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 H3BMM0 161 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 K7EIL1 84 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV3-20P01619 116 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 BCL2P10415 239 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 ERCC8Q13216 396 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 CLLU1Q5K131 121 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 RARRES2Q99969 163 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 EPDR1Q9UM22 224 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 AGRNO00468 2067 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 K7EQM0 130 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 PEX7O00628 323 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 RGS13O14921 159 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 TCRAP04437 139 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 PMS2P11Q13670 270 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 TOR2AQ5JU69 321 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.8 ms