RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557127.1

RBM23-226, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-226	ENST00000557127		K7EIL1	84 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	NMB	P08949	121 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	UBE2G2	P60604	165 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	PRELID1	Q9Y255	219 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	PGP	A6NDG6	321 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127		A0A0J9YX75	114 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	PAGE4	O60829	102 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	PPT1	P50897	306 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	PMS2P11	Q13670	270 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	GNG13	Q9P2W3	67 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	SORL1	Q92673	2214 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	HLA-DRB4	P13762	266 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	ATP5G3	P48201	142 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	GNG5	P63218	68 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-226	ENST00000557127	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127		A8MZ25	164 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	DIRC3	C9JPN6	131 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127		H3BMM0	161 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	CST9LP1	Q5W188	147 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	FBN3	Q75N90	2809 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127		A8MTW9	85 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	RGS13	O14921	159 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	IFNA1	P01562	189 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	BCL2	P10415	239 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	CSN1S1	P47710	185 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	HAGH	Q16775	308 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	EPDR1	Q9UM22	224 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	C11orf94	C9JXX5	98 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	TCRA	P04437	139 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	CLLU1	Q5K131	121 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	STH	Q8IWL8	128 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	TUBA4B	Q9H853	241 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	RBAKDN	A6NC62	111 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	PEX7	O00628	323 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	IGKV3-20	P01619	116 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	RAB14	P61106	215 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	DEFA6	Q01524	100 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	ERCC8	Q13216	396 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	AMTN	Q6UX39	209 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	VGLL1	Q99990	258 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	ATG101	Q9BSB4	218 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	CT45A10	P0DMU9	189 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	MRAP	Q8TCY5	172 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	FAM210A	Q96ND0	272 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	RARRES2	Q99969	163 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	VAX2	Q9UIW0	290 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM23-226	ENST00000557127	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		10.09	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms