RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-211ENST00000520276 DPF1Q92782 380 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-211ENST00000520276 COQ2Q96H96 371 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-211ENST00000520276 PRO0461Q9UI25 63 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPS1-211ENST00000520276 AGRNO00468 2067 aa8.02□□□□□ -1.12
TRPS1-211ENST00000520276 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.02□□□□□ -1.12
TRPS1-211ENST00000520276 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 E9PLD3 99 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 SIVA1O15304 175 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 SPINT2O43291 252 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 MOSP00540 346 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 DKK2Q9UBU2 259 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 CNIH1O95406 144 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 CSN1S1P47710 185 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 CT45A6P0DMU7 189 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 CT45A5P0DMU8 189 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 CT45A7P0DMV0 189 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 ERVK11-1P61568 191 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 UTF1Q5T230 341 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 IGLL5B9A064 214 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 P01737 135 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM178BH3BS89 294 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV4-39P01824 125 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 GAGE13Q4V321 117 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 GPR82Q96P67 336 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 TM2D2Q9BX73 214 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 METRNQ9UJH8 293 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1B0GWB2 263 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 APOMO95445 188 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-48P01763 117 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 GPR12P47775 334 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP10-9P60411 292 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF146Q15072 292 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 NFE4Q86UQ8 179 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 H3BTX0 84 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 OVOL3O00110 214 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 ERVK-16P61578 105 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZUT4 128 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 MLST8Q9BVC4 326 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM20Q8N5G0 67 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 C15orf61A6NNL5 157 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 ARMS2P0C7Q2 107 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 CFHR2P36980 270 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 ASCL2Q99929 193 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 ANAPC13Q9BS18 74 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 PAXXQ9BUH6 204 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 B4DSR2 109 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 LINC01548A6NM66 108 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 FOXI1Q12951 378 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 POLQO75417 2590 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF134P52741 427 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 GAGE5Q13069 117 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 GAGE6Q13070 117 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 FXYD5Q96DB9 178 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 NAV3Q8IVL0 2385 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 SRRM5B3KS81 715 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 LEAP2Q969E1 77 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 EPDR1Q9UM22 224 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 HIVEP2P31629 2446 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 MSMPQ1L6U9 139 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 PATE2Q6UY27 113 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 ENY2Q9NPA8 101 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 PGPA6NDG6 321 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.98□□□□□ -1.13
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