RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM231BA6NCW3 169 aa13.96□□□□□ -0.17
PTDSS1-202ENST00000517309 CKS1BP61024 79 aa13.96□□□□□ -0.17
PTDSS1-202ENST00000517309 PLEKHB2Q96CS7 222 aa13.96□□□□□ -0.17
PTDSS1-202ENST00000517309 TRBV19A0A075B6N1 114 aa13.96□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM90A2PQ658T7 463 aa13.96□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV1-39P01597 117 aa13.95□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV3-53P01767 116 aa13.95□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV1D-39P04432 117 aa13.95□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 MMP23AO75900 390 aa13.95□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.95□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 WT1-ASQ06250 92 aa13.95□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 DOCK10Q96BY6 2186 aa13.95□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF134P52741 427 aa13.95□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 C22orf46C9J442 243 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 PAX9P55771 341 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 DKK4Q9UBT3 224 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 MED13LQ71F56 2210 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 MST1LQ2TV78 715 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 RASL10AQ92737 203 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 SPRY4Q9C004 299 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 CSTL1Q9H114 145 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 LIME1Q9H400 295 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 ERCC8Q13216 396 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM14CQ9P0S9 112 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 UBE2CO00762 179 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 HIST1H2BLQ99880 126 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM238C9JI98 176 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 PFN1P07737 140 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 CT83Q5H943 113 aa13.94□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A1B0GWB2 263 aa13.93□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 SPCS1Q9Y6A9 102 aa13.93□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 ACACBO00763 2458 aa13.93□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV2A0A0B4J234 112 aa13.93□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 GRNP28799 593 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00158P58513 81 aa13.93□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 SPOCK3Q9BQ16 436 aa13.93□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 DEFB130BP0DP73 79 aa13.92□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 DEFB130AP0DP74 79 aa13.92□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 DEFB113Q30KQ7 82 aa13.92□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 TECTAO75443 2155 aa13.92□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 C11orf53Q8IXP5 236 aa13.92□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.92□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 VPREB3Q9UKI3 123 aa13.92□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 DOCK9Q9BZ29 2069 aa13.92□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 H3BRN7 92 aa13.91□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 C8orf86Q6ZUL3 223 aa13.91□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 XCL2Q9UBD3 114 aa13.91□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 HIST3H2BBQ8N257 126 aa13.91□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 CTSZQ9UBR2 303 aa13.91□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 OR11H6Q8NGC7 330 aa13.91□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 OR2K2Q8NGT1 345 aa13.91□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 C1orf159Q96HA4 380 aa13.91□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.91□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 RIPPLY3P57055 190 aa13.9□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 TPSG1Q9NRR2 321 aa13.9□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 NDUFS7O75251 213 aa13.9□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00479Q96M42 142 aa13.9□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 APOC4P55056 127 aa13.9□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 TTC32Q5I0X7 151 aa13.9□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 THAP8Q8NA92 274 aa13.9□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 HSD52Q0P140 79 aa13.9□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 AMN1Q8IY45 258 aa13.9□□□□□ -0.18
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A087WWL8 130 aa13.89□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 LHBP01229 141 aa13.89□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 SPINK13Q1W4C9 94 aa13.89□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa13.89□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLC1P0CG04 106 aa13.89□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 S100A7L2Q5SY68 101 aa13.89□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 ORAOV1Q8WV07 137 aa13.89□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.89□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 PAX2Q02962 417 aa13.89□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa13.89□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 A8MWV9 139 aa13.88□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 CDKN1BP46527 198 aa13.88□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa13.88□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa13.88□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 SS18Q15532 418 aa13.88□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa13.88□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 PSCAO43653 123 aa13.88□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 DAD1P61803 113 aa13.88□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 DEFB112Q30KQ8 113 aa13.88□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 LY6G5BQ8NDX9 201 aa13.88□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM158Q8WZ71 300 aa13.88□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6ZSR3 168 aa13.87□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 PRSS46E5RG02 174 aa13.87□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 C6orf226Q5I0X4 101 aa13.87□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 TYMSP04818 313 aa13.87□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.87□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 H3BUT2 72 aa13.87□□□□□ -0.19
PTDSS1-202ENST00000517309 JPT2Q9H910 190 aa13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.8 ms