RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495522.1

CALD1-222, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CALD1, Length 2,199 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-222	ENST00000495522	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CALD1-222	ENST00000495522	OVOL3	O00110	214 aa		11.96	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	CRIP1	P50238	77 aa		11.96	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	ECSCR	Q19T08	205 aa		11.96	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	KLK9	Q2XQG4	91 aa		11.96	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		11.96	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		11.96	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	NPFF	O15130	113 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	PTTG1IP	P53801	180 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	RIG	Q13278	110 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522		Q6AWC8	147 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	C8orf49	Q96NF6	230 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	ATP6V0E1	O15342	81 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	CTRL	P40313	264 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	C15orf32	Q32M92	178 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522		A0A1B0GW15	77 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	SPATA45	Q537H7	98 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	GPR183	P32249	361 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	RHOG	P84095	191 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	USP24	Q9UPU5	2620 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	PMCHL1	Q16048	86 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	GATD1	Q8NB37	220 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM238	C9JI98	176 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	BMI1	P35226	326 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	UBE2V1	Q13404	147 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	C2orf70	A6NJV1	201 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522		M0QZ24	198 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	CCL25	O15444	150 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	IGHV4-39	P01824	125 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	CLEC3B	P05452	202 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	RAB9A	P51151	201 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	LCN12	Q6JVE5	192 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	CACNA1B	Q00975	2339 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM189	A5PLL7	270 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	SH2D1A	O60880	128 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	GOSR1	O95249	250 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	PRR25	Q96S07	402 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	CSTL1	Q9H114	145 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	MED13L	Q71F56	2210 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522	TPPP3	Q9BW30	176 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CALD1-222	ENST00000495522		G3V318	75 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	IGHG4	P01861	327 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	CCDC140	Q96MF4	163 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522		A0A087X0K7	114 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	LINC01548	A6NM66	108 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	IGLC3	P0DOY3	106 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	PAX8	Q06710	450 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	ATOH7	Q8N100	152 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	BUB3	O43684	328 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	VGLL1	Q99990	258 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	LEPROTL1	O95214	131 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	OR5AL1	P0C617	328 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	HLA-DMB	P28068	263 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522		Q8TAT8	98 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	IGHV1-69	P01742	117 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	VPS25	Q9BRG1	176 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	CBY3	A6NI87	242 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF138	P52744	262 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CALD1-222	ENST00000495522	BATF	Q16520	125 aa		11.86	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms