RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 HLA-DMBP28068 263 aa9.26□□□□□ -0.93
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CNMD-201ENST00000377962 PDE6HQ13956 83 aa9.26□□□□□ -0.93
CNMD-201ENST00000377962 PSMG4Q5JS54 123 aa9.26□□□□□ -0.93
CNMD-201ENST00000377962 SUN5Q8TC36 379 aa9.26□□□□□ -0.93
CNMD-201ENST00000377962 C20orf173Q96LM9 149 aa9.26□□□□□ -0.93
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CNMD-201ENST00000377962 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.24□□□□□ -0.93
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CNMD-201ENST00000377962 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.24□□□□□ -0.93
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CNMD-201ENST00000377962 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
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CNMD-201ENST00000377962 SPATA25Q9BR10 227 aa9.22□□□□□ -0.93
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CNMD-201ENST00000377962 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 PPT1P50897 306 aa9.21□□□□□ -0.94
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CNMD-201ENST00000377962 NMBP08949 121 aa9.2□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 CSN1S1P47710 185 aa9.2□□□□□ -0.94
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CNMD-201ENST00000377962 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.2□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.2□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.2□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.2□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.2□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 TENM3Q9P273 2699 aa9.19□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 A0A0J9YX75 114 aa9.19□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 H3BMM0 161 aa9.19□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 APOC4P55056 127 aa9.19□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 RAB14P61106 215 aa9.19□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 PMS2P11Q13670 270 aa9.19□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 STHQ8IWL8 128 aa9.19□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.19□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 DIRC3C9JPN6 131 aa9.18□□□□□ -0.94
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CNMD-201ENST00000377962 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.18□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.18□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 CSTL1Q9H114 145 aa9.18□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 MANBALQ9NQG1 85 aa9.18□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 EPDR1Q9UM22 224 aa9.18□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.18□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.18□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.18□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.17□□□□□ -0.94
CNMD-201ENST00000377962 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.17□□□□□ -0.94
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