RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa11.21□□□□□ -0.61
NICN1-201ENST00000273598 LCN12Q6JVE5 192 aa11.21□□□□□ -0.61
NICN1-201ENST00000273598 RNF182Q8N6D2 247 aa11.21□□□□□ -0.61
NICN1-201ENST00000273598 FOXC2Q99958 501 aa11.21□□□□□ -0.61
NICN1-201ENST00000273598 PRDM13Q9H4Q3 707 aa11.21□□□□□ -0.61
NICN1-201ENST00000273598 ZNF702PQ9H963 129 aa11.21□□□□□ -0.61
NICN1-201ENST00000273598 U3KQE9 123 aa11.21□□□□□ -0.61
NICN1-201ENST00000273598 A0A087X0K7 114 aa11.21□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 SNURFLB1AK76 121 aa11.21□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa11.21□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 HOXA5P20719 270 aa11.21□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 PDZD11Q5EBL8 140 aa11.21□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.21□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa11.2□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 TSKUQ8WUA8 353 aa11.2□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.2□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 ZNF492Q9P255 531 aa11.2□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.2□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.2□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 YAE1D1Q9NRH1 226 aa11.2□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 NAT8BQ9UHF3 227 aa11.2□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 XKRY2A2RUG3 117 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 C19orf71A6NCJ1 209 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 HIGD1CA8MV81 97 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 CT45A10P0DMU9 189 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 C8orf49Q96NF6 230 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 NEU1Q99519 415 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 A0A1W2PS18 150 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 A8MWL6 223 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 TM4SF20Q53R12 229 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 C8orf86Q6ZUL3 223 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 TCF24Q7RTU0 167 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 NUP35Q8NFH5 326 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 VGLL1Q99990 258 aa11.19□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 TMEM89A2RUT3 159 aa11.18□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 OR2D3Q8NGH3 330 aa11.18□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 C16orf92Q96LL3 132 aa11.18□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.18□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 MEOX2P50222 304 aa11.18□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa11.18□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 Q8TAT8 98 aa11.18□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 GLMPQ8WWB7 406 aa11.18□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 MXRA5Q9NR99 2828 aa11.18□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 S100A2P29034 98 aa11.17□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 GNB1LQ9BYB4 327 aa11.17□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 ITPR2Q14571 2701 aa11.17□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 ERCC8Q13216 396 aa11.17□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa11.17□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 WDR73Q6P4I2 378 aa11.17□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa11.17□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.17□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 SELENOKQ9Y6D0 94 aa11.17□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 ACANP16112 2415 aa11.17□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 PRAC2D3DTV9 90 aa11.16□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 ELANEP08246 267 aa11.16□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 FOXE3Q13461 319 aa11.16□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 UNC79Q9P2D8 2635 aa11.16□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 GZMBP10144 247 aa11.16□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 COX19Q49B96 90 aa11.16□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 CT83Q5H943 113 aa11.16□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.16□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 PGLYRP4Q96LB8 373 aa11.16□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 PRR25Q96S07 402 aa11.16□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 NDFIP1Q9BT67 221 aa11.16□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa11.15□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 CD5LO43866 347 aa11.15□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 CAMPP49913 170 aa11.15□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 PDZD2O15018 2839 aa11.15□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.15□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 FAM181BA6NEQ2 426 aa11.15□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 MT-ND6P03923 174 aa11.15□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 CRIP1P50238 77 aa11.15□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 TMEM136Q6ZRR5 245 aa11.15□□□□□ -0.62
NICN1-201ENST00000273598 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 NPIPB6E9PJ23 425 aa11.14□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 S100A8P05109 93 aa11.14□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 GPHB5Q86YW7 130 aa11.14□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 LINC00518Q8N0U6 118 aa11.14□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.14□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 GTSF1Q8WW33 167 aa11.14□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 GRIFINA4D1Z8 144 aa11.14□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 KIAA1644Q3SXP7 199 aa11.14□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa11.13□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 HLA-DQA1P01909 254 aa11.13□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP1-1Q07627 177 aa11.13□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 FAM162BQ5T6X4 162 aa11.13□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 TMEM86BQ8N661 226 aa11.13□□□□□ -0.63
NICN1-201ENST00000273598 KLHDC1Q8N7A1 406 aa11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms