RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 DEFB130BP0DP73 79 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 DEFB130AP0DP74 79 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 CRYBA2P53672 197 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 C15orf32Q32M92 178 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 CNTFRP26992 372 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 Q8TCH9 128 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 ASCL2Q99929 193 aa6.35□□□□□ -1.39
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USP3-201ENST00000268049 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 FOXE3Q13461 319 aa6.35□□□□□ -1.39
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USP3-201ENST00000268049 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.35□□□□□ -1.39
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USP3-201ENST00000268049 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
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USP3-201ENST00000268049 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 POLEQ07864 2286 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 CD55P08174 381 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 STPG4Q8N801 248 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 CACNA1AO00555 2505 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 CD24P25063 80 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 H3BMM0 161 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 LYL1P12980 280 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 Q6ZWC4 215 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 UBE2WQ96B02 151 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 PROK2Q9HC23 129 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-201ENST00000268049 ROS1P08922 2347 aa6.34□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 CCL25O15444 150 aa6.34□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 PIFOQ8TCI5 191 aa6.34□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 M0R381 172 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 LY6HO94772 140 aa6.33□□□□□ -1.4
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USP3-201ENST00000268049 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 C14orf177Q52M58 125 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 LYPD3O95274 346 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 SS18Q15532 418 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 RNF125Q96EQ8 232 aa6.33□□□□□ -1.4
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USP3-201ENST00000268049 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 MMP23AO75900 390 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 GAFA1Q96PS6 74 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 S4R3C0 116 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 TMEM258P61165 79 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 ZNF114Q8NC26 417 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 J3KT08 172 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 CRYBA4P53673 196 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 VSIRQ9H7M9 311 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 F8W735 103 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 DKK1O94907 266 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 CT83Q5H943 113 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 TM2D1Q9BX74 207 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 TMEM126AQ9H061 195 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 RFNGQ9Y644 331 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 Q9H3A6 140 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 MORN2Q502X0 79 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 OVOL3O00110 214 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 GNG5P63218 68 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP3-201ENST00000268049 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.3□□□□□ -1.4
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