RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	COX7C	P15954	63 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	HBB	P68871	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	TFF3	Q07654	80 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	FGF14	Q92915	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	CCL1	P22362	96 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	KISS1	Q15726	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	FHL5	Q5TD97	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	AICDA	Q9GZX7	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	CISD3	P0C7P0	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	CRYGA	P11844	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	NPC2	P61916	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LIME1	Q9H400	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	PRSS1	P07477	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	C17orf51	A8MQB3	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	VWA8	A3KMH1	1905 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072		J3QT63	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	NCR2	O95944	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	TCL1B	O95988	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	CD24	P25063	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	FHL1	Q13642	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC25A20	O43772	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LTA	P01374	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKC	P01834	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	SPINT3	P49223	89 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072		H3BT86	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LYPD6	Q86Y78	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	TCF15	Q12870	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	METTL26	Q96S19	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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