RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525116.5

CASP4-205, Transcript of caspase 4, human

TSL 2

Gene CASP4, Length 684 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP4-205	ENST00000525116	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	METTL26	Q96S19	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	GOSR2	O14653	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	SNCA	P37840	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	P2RY1	P47900	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116		Q6ZR54	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	AP3S1	Q92572	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-205	ENST00000525116	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	GPR31	O00270	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	SIVA1	O15304	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	CD74	P04233	296 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	PET100	P0DJ07	73 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	PSMB9	P28065	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	SDC2	P34741	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	FXYD7	P58549	80 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	SSR3	Q9UNL2	185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116		H3BTX0	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116		M0R036	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	BUB3	O43684	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	PMCH	P20382	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	CRYBB3	P26998	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	ETV6	P41212	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	DEFB1	P60022	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	CENPX	A8MT69	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116		H3BMM0	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	ADAP1	O75689	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	IFNA5	P01569	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	S100G	P29377	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	HRH1	P35367	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	OPRK1	P41145	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	RNF212	Q495C1	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	HSBP1	O75506	76 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	TAS2R46	P59540	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	TAS2R20	P59543	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-205	ENST00000525116	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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