RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, human

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKDCC-208	ENST00000490302	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302		A0A087X0K7	114 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	EPM2A	B3EWF7	344 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302		H7BYZ3	331 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	HYPM	O75409	117 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	LRTM2	Q8N967	370 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	SMCO3	A2RU48	225 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	CCDC160	A6NGH7	325 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302		H3BP45	60 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	OR5G3	P0C626	314 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	VAMP1	P23763	118 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-208	ENST00000490302	LINC00869	P0C866	280 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	HOXA5	P20719	270 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	PLP1	P60201	277 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	S100A7A	Q86SG5	101 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	GAGE12B	A1L429	117 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302		H3BNG1	76 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	GAGE7	O76087	117 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	RLN2	P04090	185 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	GAGE12F	P0CL80	117 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	GAGE12G	P0CL81	117 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	GAGE12I	P0CL82	117 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	HOXB5	P09067	269 aa		12	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	SELENOT	P62341	195 aa		12	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	MCFD2	Q8NI22	146 aa		12	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	SNURFL	B1AK76	121 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	LINC00315	P59091	139 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	RNF24	Q9Y225	148 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	SFT2D2	O95562	160 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	CXCL2	P19875	107 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	ARL6	Q9H0F7	186 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	FABP12	A6NFH5	140 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	TNFSF8	P32971	234 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	LCN15	Q6UWW0	184 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	PATE2	Q6UY27	113 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	CCDC190	Q86UF4	302 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	ARV1	Q9H2C2	271 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	PPP1R1A	Q13522	171 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	SOST	Q9BQB4	213 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKDCC-208	ENST00000490302	EREG	O14944	169 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	AP3S2	P59780	193 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	ID3	Q02535	119 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	HERC1	Q15751	4861 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302		A0A096LPF7	62 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	PRAC2	D3DTV9	90 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302		J3KRW8	73 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302		K7EPK0	472 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	SIVA1	O15304	175 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	CCNK	O75909	580 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	S100A5	P33763	92 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	ERVFC1-1	P60608	527 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	TEPP	Q6URK8	271 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302		Q6ZTI0	123 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	FNDC10	F2Z333	226 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	SSSCA1	O60232	199 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	LEP	P41159	167 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKDCC-208	ENST00000490302	XG	P55808	180 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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