RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459963.5

NCSTN-209, Transcript of nicastrin, human

TSL 5

Gene NCSTN, Length 1,246 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCSTN-209	ENST00000459963	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	IL4	P05112	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	PSMB9	P28065	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	SDC2	P34741	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	RFX2	P48378	723 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	IDNK	Q5T6J7	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCSTN-209	ENST00000459963	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	TGFBR1	P36897	503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	PSG3	Q16557	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	CT83	Q5H943	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	COMMD9	Q9P000	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	F2R	P25116	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	RANBP1	P43487	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	TIRAP	P58753	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	RAP2B	P61225	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963		A0A087WYN8	130 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	CORT	O00230	105 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	ORM1	P02763	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	OPRK1	P41145	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	PPT1	P50897	306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	RHOB	P62745	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	OR2F1	Q13607	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	SPCS2	Q15005	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	MSMO1	Q15800	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	SSR3	Q9UNL2	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	GPR31	O00270	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	SCGN	O76038	276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	HRH1	P35367	487 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	MEOX2	P50222	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	TMBIM6	P55061	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	RMI2	Q96E14	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	SPINK4	O60575	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	TOMM40	O96008	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	OR10J1	P30954	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	SNCA	P37840	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCSTN-209	ENST00000459963	TAS2R20	P59543	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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