RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447271.1

PTPN3-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, human

TSL 2

Gene PTPN3, Length 587 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN3-205	ENST00000447271	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	CITED1	Q99966	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	NDUFS8	O00217	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	NBR2	O15453	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	GNG7	O60262	68 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	NDUFB8	O95169	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	REG1A	P05451	166 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	CRYGC	P07315	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	CXCL1	P09341	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	FABP4	P15090	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	CCL3L1	P16619	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	ORM2	P19652	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	CRYBB3	P26998	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	BMI1	P35226	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	RAB4B	P61018	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	CX3CL1	P78423	397 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	HES1	Q14469	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	C20orf202	A1L168	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	PGP	A6NDG6	321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	BMPR1B	O00238	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	PEX7	O00628	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271		P01737	135 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	APCS	P02743	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	AMY1A	P04745	511 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	ATP5G3	P48201	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	UBE2E1	P51965	193 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	DLX6	P56179	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	FXYD3	Q14802	87 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	MMD	Q15546	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF253	O75346	499 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	MMP23A	O75900	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	TOMM40	O96008	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ESD	P10768	282 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SELL	P14151	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	GATA3	P23771	443 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	COL8A2	P25067	703 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	REG1B	P48304	166 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	LINC00205	P59089	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	WT1-AS	Q06250	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	RIG	Q13278	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	TEX29	Q8N6K0	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271		Q8N7P7	452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms