RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TUBA4BQ9H853 241 aa7.25□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.25□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.25□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DOK5Q9P104 306 aa7.25□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.25□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MUC4Q99102 2169 aa7.25□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A087WWC5 75 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.24□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 UBE2G2P60604 165 aa7.24□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q8WTZ3 238 aa7.24□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PAXXQ9BUH6 204 aa7.24□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 CEBPGP53567 150 aa7.23□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC140Q96MF4 163 aa7.23□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.23□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.23□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNF24Q9Y225 148 aa7.23□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 GGTLC3B5MD39 225 aa7.22□□□□□ -1.25
SOX9-AS1-201ENST00000412640 M0R036 132 aa7.22□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR10J4P0C629 311 aa7.22□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 S100A7P31151 101 aa7.22□□□□□ -1.25
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 HERC1Q15751 4861 aa7.21□□□□□ -1.26
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 C9JCJ5 164 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TSPAN4O14817 238 aa7.21□□□□□ -1.26
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 TGOLN2O43493 480 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NDUFB4O95168 129 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHG4P01861 327 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLEC3BP05452 202 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPATA25Q9BR10 227 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRELID1Q9Y255 219 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A0G2JLM5 398 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CXorf65A6NEN9 183 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF98A6NK75 572 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BMPR1BO00238 502 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHV3-23P01764 117 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRGV3P03979 118 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLC2P0DOY2 106 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSMB8P28062 276 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPR183P32249 361 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM209BQ5JX69 171 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.2□□□□□ -1.26
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