RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 BRS3P32247 399 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 NOVP48745 357 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 KISS1Q15726 138 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 KHDC3LQ587J8 217 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 LINC01545Q5VT33 79 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 GFI1BQ5VTD9 330 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 DPPA3Q6W0C5 159 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 SVBPQ8N300 66 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 LINC00311Q8N616 119 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 U3KQK5 164 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 MED14O60244 1454 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 LTBP1Q14766 1721 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
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CS-232ENST00000552331 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 RGS12O14924 1447 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 ADGRL2O95490 1459 aa2.35□□□□□ -2.03
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CS-232ENST00000552331 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa2.35□□□□□ -2.03
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CS-232ENST00000552331 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 LHBP01229 141 aa2.35□□□□□ -2.03
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CS-232ENST00000552331 RBP4P02753 201 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 ZNF19P17023 458 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 RPS10P46783 165 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 CATR1Q13166 79 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 KLRD1Q13241 179 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 Q6ZQT7 251 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 RPRMLQ8N4K4 120 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 TTC9CQ8N5M4 171 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 FAM216BQ8N7L0 139 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 C9orf106Q8NAJ2 232 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 PFN4Q8NHR9 129 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 DIRC1Q969H9 104 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 SLC35B3Q9H1N7 401 aa2.35□□□□□ -2.03
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CS-232ENST00000552331 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
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CS-232ENST00000552331 ERICH3Q5RHP9 1530 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 NISCHQ9Y2I1 1504 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 C19orf71A6NCJ1 209 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 M0R129 80 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 LINC01565O15544 149 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 IGKV3-20P01619 116 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 CD2P06729 351 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 SPINK8P0C7L1 97 aa2.34□□□□□ -2.03
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CS-232ENST00000552331 CD24P25063 80 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 XCL1P47992 114 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 DYNLT1P63172 113 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 ZNF90Q03938 601 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 Q56UQ5 140 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 CLLU1Q5K131 121 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 C10orf111Q8N326 155 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 C5orf17Q8NAS9 161 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-232ENST00000552331 PTPRBP23467 1997 aa2.34□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 CROCCQ5TZA2 2017 aa2.34□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 RIC1Q4ADV7 1423 aa2.34□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 CEP162Q5TB80 1403 aa2.34□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa2.33□□□□□ -2.04
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CS-232ENST00000552331 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 A0A1W2PQD3 144 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 H3BT86 120 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 MPC2O95563 127 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 APOC2P02655 101 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 IGLV7-43P04211 117 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 COX6A1P12074 109 aa2.33□□□□□ -2.04
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