RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 UPK2O00526 184 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV4-39P01824 125 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 HOGA1Q86XE5 327 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 PDPNQ86YL7 162 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00477Q96M19 166 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 NABP2Q9BQ15 211 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 RPRMQ9NS64 109 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-13P01766 116 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 GCHFRP30047 84 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 SPACA5Q96QH8 159 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CACNA1CQ13936 2221 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 F6UB75 175 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 WFDC11Q8NEX6 87 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 LCTP09848 1927 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 MSGN1A6NI15 193 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 RPS27P42677 84 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB108AA8MXU0 73 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 RHODO00212 210 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 WFDC2Q14508 124 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 TSKUQ8WUA8 353 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 RNF5Q99942 180 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf51A8MQB3 221 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 LY6EQ16553 131 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 NMSQ5H8A3 153 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 C5orf24Q7Z6I8 188 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CEND1Q8N111 149 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 M0R2P5 195 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01545Q5VT33 79 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 Q6AWC8 147 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 RNF126Q9BV68 326 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 WDR81Q562E7 1941 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 LYZP61626 148 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 Q0VFX4 171 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CFHR4Q92496 578 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 VSIRQ9H7M9 311 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A20O43772 301 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 LEPP41159 167 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF645Q8N7E2 425 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 RFNGQ9Y644 331 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CEP250Q9BV73 2442 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa5.17□□□□□ -1.58
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PTPRB-210ENST00000551525 CD164Q04900 197 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 GAPTQ8N292 157 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A15Q9Y619 301 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 IGKCP01834 107 aa5.17□□□□□ -1.58
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PTPRB-210ENST00000551525 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF137PP52743 207 aa5.16□□□□□ -1.58
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PTPRB-210ENST00000551525 IGFL2Q6UWQ7 119 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 C20orf78Q9BR46 151 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 C9JQL5 133 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 EGR1P18146 543 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 EFNB3Q15768 340 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 DEPPQ9NTK1 212 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 MYOFQ9NZM1 2061 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 DOCK6Q96HP0 2047 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 TEX22C9J3V5 150 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 NPPCP23582 126 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 SVILO95425 2214 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CACNA1HO95180 2353 aa5.16□□□□□ -1.58
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