RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 PATE2Q6UY27 113 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 RAB24Q969Q5 203 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 VSIRQ9H7M9 311 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 DOK5Q9P104 306 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 TMEM213A2RRL7 107 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 STAG3L2P0CL84 134 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 STAG3L3P0CL85 134 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 FOLR2P14207 255 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 PSMB3P49720 205 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 PAFAH1B2P68402 229 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 TM4SF20Q53R12 229 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 CUBNO60494 3623 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 STAB1Q9NY15 2570 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 CHEK1O14757 476 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 RGS13O14921 159 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 WIPF1O43516 503 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 ZNF253O75346 499 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 CD33P20138 364 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 PMS2P11Q13670 270 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 PDE6HQ13956 83 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 UHRF2Q96PU4 802 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 PAXXQ9BUH6 204 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 OR51M1Q9H341 326 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-220ENST00000550700 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.09□□□□□ -1.27
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CS-220ENST00000550700 OR7C2O60412 319 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 IFNA1P01562 189 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 CSN3P07498 182 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 PSG9Q00887 426 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 PRR31Q5SQ13 230 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 LCN15Q6UWW0 184 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 SUN5Q8TC36 379 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 GLMPQ8WWB7 406 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 DUX3Q96PT4 197 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.08□□□□□ -1.28
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CS-220ENST00000550700 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.07□□□□□ -1.28
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CS-220ENST00000550700 SAP30O75446 220 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 ID1P41134 155 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 LCN12Q6JVE5 192 aa7.07□□□□□ -1.28
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CS-220ENST00000550700 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 NRN1Q9NPD7 142 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 MANBALQ9NQG1 85 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 RFNGQ9Y644 331 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PRE2 83 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 OR4C46A6NHA9 309 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 TSPAN4O14817 238 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.06□□□□□ -1.28
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CS-220ENST00000550700 GCHFRP30047 84 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 FHITP49789 147 aa7.06□□□□□ -1.28
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