RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 A8MWL6 223 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 FBLN7Q53RD9 439 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 OSTCQ9NRP0 149 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 ZNF292O60281 2723 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 C7orf71A4D174 169 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 C22orf46C9J442 243 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 MT-ND6P03923 174 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 GCSHP23434 173 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 ARL3P36405 182 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 PDLIM4P50479 330 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 CACNG7P62955 275 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 AMN1Q8IY45 258 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 TMEM186Q96B77 213 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 ZNF785A8K8V0 405 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 RAB1CQ92928 201 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 RAB9BQ9NP90 201 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 VWC2LB2RUY7 222 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 H3BUT2 72 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 FOXE3Q13461 319 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 CTSZQ9UBR2 303 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 C17orf100A8MU93 164 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 VSTM5A8MXK1 200 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 NDUFB8O95169 186 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 IGLV2-8P01709 118 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 PRSS33Q8NF86 280 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 ADIPOQQ15848 244 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 AARDQ4LEZ3 155 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 PRR7Q8TB68 274 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 GLMPQ8WWB7 406 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 GPR82Q96P67 336 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 D6R8Y8 96 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 K7EP13 123 aa6.67□□□□□ -1.34
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SNX13-201ENST00000409076 LINC00614P0C842 121 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 DEFB1P60022 68 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 S100A7AQ86SG5 101 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 C9JCJ5 164 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 PRSS46E5RG02 174 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 TIMM23O14925 209 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 HTN1P15515 57 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 GTSF1Q8WW33 167 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 A0A0G2JNJ9 132 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 TCRAP04437 139 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 CLEC3BP05452 202 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 SRD5A1P18405 259 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 CKS2P33552 79 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 ERCC8Q13216 396 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 RNF182Q8N6D2 247 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 DDB2Q92466 427 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 FXYD5Q96DB9 178 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 SPRY4Q9C004 299 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 Q9UFV3 132 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 COL4A2P08572 1712 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 PIEZO1Q92508 2521 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 TDGF1P13385 188 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 IGKV3-20P01619 116 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 NDPQ00604 133 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 SCGB2A2Q13296 93 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 NDUFS7O75251 213 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 SAP30O75446 220 aa6.66□□□□□ -1.34
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