RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 CACNG7P62955 275 aa16.78■□□□□ 0.28
NISCH-201ENST00000345716 MEIG1Q5JSS6 88 aa16.78■□□□□ 0.28
NISCH-201ENST00000345716 ACTL10Q5JWF8 245 aa16.78■□□□□ 0.28
NISCH-201ENST00000345716 NDUFAF3Q9BU61 184 aa16.78■□□□□ 0.28
NISCH-201ENST00000345716 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa16.77■□□□□ 0.28
NISCH-201ENST00000345716 TOMM40O96008 361 aa16.77■□□□□ 0.28
NISCH-201ENST00000345716 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa16.77■□□□□ 0.28
NISCH-201ENST00000345716 PLP1P60201 277 aa16.77■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 TEX36Q5VZQ5 186 aa16.77■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 TTC9CQ8N5M4 171 aa16.77■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 Q8NFD4 153 aa16.77■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 WFDC12Q8WWY7 111 aa16.77■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 C2orf16Q68DN1 1984 aa16.77■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 SMIM13P0DJ93 91 aa16.77■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 EVI2AP22794 236 aa16.76■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 CNTFRP26992 372 aa16.76■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 ZNF134P52741 427 aa16.76■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa16.76■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 NDPQ00604 133 aa16.76■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 NUP35Q8NFH5 326 aa16.76■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 NDUFA3O95167 84 aa16.76■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 PSMG4Q5JS54 123 aa16.76■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 ZNF329Q86UD4 541 aa16.76■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 C11orf44Q8N8P7 122 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 ST20Q9HBF5 79 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 TMEM256Q8N2U0 113 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 LINC00479Q96M42 142 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 LTBP2Q14767 1821 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 MMP23AO75900 390 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 Q8TAT8 98 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 TDGF1P13385 188 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 RASL11AQ6T310 242 aa16.75■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 COL4A3Q01955 1670 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 IGFL4Q6B9Z1 124 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 LYPD1Q8N2G4 141 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.275e-7■■■■□ 23
NISCH-201ENST00000345716 IL15RAQ13261 267 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 PSG3Q16557 428 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 LYZL1Q6UWQ5 148 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 CYB5R2Q6BCY4 276 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 ZNF562Q6V9R5 426 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 PRSS33Q8NF86 280 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 MED13LQ71F56 2210 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 NBL1P41271 181 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 ZNF726P1Q15940 193 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 STHQ8IWL8 128 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 ZNF138P52744 262 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 LCN12Q6JVE5 192 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 TMEM262E9PQX1 116 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 COTL1Q14019 142 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 C9orf139Q6ZV77 190 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 SSC4DQ8WTU2 575 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 SHANK1Q9Y566 2161 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 SH2D1AO60880 128 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 HAPLN4Q86UW8 402 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 LINC00311Q8N616 119 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 NCR2O95944 276 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 TMEM101Q96IK0 257 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 CREBBPQ92793 2442 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 C11orf53Q8IXP5 236 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-201ENST00000345716 ABCA1O95477 2261 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 TRGV2A0A075B6R0 118 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 D6R8Y8 96 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 26.8
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NISCH-201ENST00000345716 UBE2E1P51965 193 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 COPS9Q8WXC6 57 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 C2orf88Q9BSF0 95 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 LYPD6Q86Y78 171 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 ZGRF1Q86YA3 2104 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 IFI27L1Q96BM0 104 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 SMIM12Q96EX1 92 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 USMG5Q96IX5 58 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 DOCK11Q5JSL3 2073 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 K7EM74 188 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 EMP1P54849 157 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 ORMDL2Q53FV1 153 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 JKAMPQ9P055 326 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 Q86TA4 180 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 Q6ZSR3 168 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 CYSLTR1Q9Y271 337 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 ZNF688P0C7X2 276 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 MRAP2Q96G30 205 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 FAM223BA6NKX1 122 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 FAM223AQ8IWN6 122 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 BDP1A6H8Y1 2624 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 TRGV11A0A075B6L2 103 aa16.68■□□□□ 0.26
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