RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd209gD3Z5D4 194 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gsg1lD3Z7H4 322 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr544E9PX47 334 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mfsd4b5E9PYY6 479 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm2564F6Z9S8 108 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm9602J3QPD5 205 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr628K7N6B2 316 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr191L7N1Z8 309 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MsmbO08540 113 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccl19O70460 108 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AhsgP29699 345 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hmga2P52927 108 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Btbd35f14Q1LZI5 498 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp772Q3UQL6 416 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lhfpl5Q4KL25 219 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd13bQ5F259 626 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1000Q7TR99 314 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptbp3Q8BHD7 523 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Harbi1Q8BR93 349 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr112Q8C0S2 320 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cmc2Q8K199 79 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RfxapQ8VCG9 231 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1368Q8VFG3 314 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rasl11bQ922H7 247 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf281Q99LI5 893 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ucn2Q99ML8 113 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rer1Q9CQU3 196 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 UrahQ9CRB3 118 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhebl1Q9D8T3 184 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ovol1Q9WTJ2 267 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav18A0A075B656 109 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Btbd35f21A0A140T8Q5 498 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam136b-psA0A140T8T1 138 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm11756A2BEJ1 356 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr906K7N5P3 311 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cnih1O35372 144 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Saa1P05366 122 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hsf1P38532 525 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 S100a11P50543 98 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arpc4P59999 168 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ube2kP61087 200 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl30P62889 115 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stx4P70452 298 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc35b1P97858 322 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adra2aQ01338 450 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nxt2Q3UNA4 142 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm9758Q80ZT2 255 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem11Q8BK08 190 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp459Q8BZ17 267 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rgs13Q8K443 158 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r192Q8K4C9 300 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr135Q8VEY4 312 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr99Q8VFE4 305 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr473Q8VG44 310 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr101Q920Z0 308 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9CX25 107 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fkbp11Q9D1M7 201 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ssr3Q9DCF9 185 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hacd1Q9QY80 281 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm29049A0A087WSM5 227 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm45716A0A1B0GRQ0 93 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm17727E9Q4V7 109 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 1700056E22RikF7CNM6 234 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21118J3QPK8 227 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ren2P00796 401 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q0VG49 157 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psg19Q4KL31 475 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20909Q5FWB5 227 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20852Q5M8R5 227 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20917Q62457 227 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20809Q62458 227 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 OpalinQ7M750 143 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20738Q810R8 227 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ncs1Q8BNY6 190 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd200r5Q8BTP3 270 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10309Q8C648 119 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm9949Q8C9F4 104 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd300eQ8K249 196 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp958Q99LG7 467 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rwdd2bQ99M03 290 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CrygfQ9CXV3 174 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Necap2Q9D1J1 266 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20806Q9D9T3 227 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr951Q9EQ94 314 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pf4Q9Z126 105 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv5-6A0A075B5Q0 117 aa8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-36A0A0A6YXT2 117 aa8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav7-5A0A0G2JFX6 112 aa8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trbv29A0A0G2LB96 114 aa8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8220F6YKI2 213 aa8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1053L7MU59 313 aa8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chrna7P49582 502 aa8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tex30Q3TUU5 225 aa8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc160Q3UYG1 323 aa8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cbx5Q61686 191 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sqstm1Q64337 442 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubald1Q6P3B2 176 aa8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnd1Q6VY05 352 aa8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr517Q7TRU4 314 aa8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr504Q7TRU7 318 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.5 ms