Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL25

Lhfpl5, LHFPL tetraspan subfamily member 5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl5Q4KL25 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Lhfpl5Q4KL25 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lhfpl5Q4KL25 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lhfpl5Q4KL25 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lhfpl5Q4KL25 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lhfpl5Q4KL25 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lhfpl5Q4KL25 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lhfpl5Q4KL25 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lhfpl5Q4KL25 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lhfpl5Q4KL25 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lhfpl5Q4KL25 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lhfpl5Q4KL25 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lhfpl5Q4KL25 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lhfpl5Q4KL25 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lhfpl5Q4KL25 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lhfpl5Q4KL25 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Lhfpl5Q4KL25 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lhfpl5Q4KL25 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lhfpl5Q4KL25 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lhfpl5Q4KL25 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lhfpl5Q4KL25 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lhfpl5Q4KL25 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lhfpl5Q4KL25 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lhfpl5Q4KL25 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lhfpl5Q4KL25 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lhfpl5Q4KL25 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lhfpl5Q4KL25 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lhfpl5Q4KL25 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lhfpl5Q4KL25 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lhfpl5Q4KL25 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lhfpl5Q4KL25 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lhfpl5Q4KL25 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lhfpl5Q4KL25 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lhfpl5Q4KL25 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lhfpl5Q4KL25 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lhfpl5Q4KL25 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lhfpl5Q4KL25 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lhfpl5Q4KL25 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lhfpl5Q4KL25 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lhfpl5Q4KL25 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lhfpl5Q4KL25 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lhfpl5Q4KL25 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lhfpl5Q4KL25 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lhfpl5Q4KL25 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lhfpl5Q4KL25 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lhfpl5Q4KL25 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lhfpl5Q4KL25 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhfpl5Q4KL25 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhfpl5Q4KL25 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lhfpl5Q4KL25 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lhfpl5Q4KL25 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lhfpl5Q4KL25 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lhfpl5Q4KL25 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lhfpl5Q4KL25 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lhfpl5Q4KL25 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lhfpl5Q4KL25 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lhfpl5Q4KL25 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lhfpl5Q4KL25 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lhfpl5Q4KL25 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lhfpl5Q4KL25 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lhfpl5Q4KL25 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lhfpl5Q4KL25 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lhfpl5Q4KL25 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lhfpl5Q4KL25 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lhfpl5Q4KL25 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhfpl5Q4KL25 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhfpl5Q4KL25 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhfpl5Q4KL25 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhfpl5Q4KL25 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lhfpl5Q4KL25 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lhfpl5Q4KL25 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lhfpl5Q4KL25 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lhfpl5Q4KL25 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lhfpl5Q4KL25 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lhfpl5Q4KL25 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lhfpl5Q4KL25 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lhfpl5Q4KL25 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lhfpl5Q4KL25 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lhfpl5Q4KL25 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lhfpl5Q4KL25 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lhfpl5Q4KL25 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lhfpl5Q4KL25 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lhfpl5Q4KL25 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lhfpl5Q4KL25 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lhfpl5Q4KL25 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lhfpl5Q4KL25 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lhfpl5Q4KL25 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lhfpl5Q4KL25 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lhfpl5Q4KL25 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lhfpl5Q4KL25 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lhfpl5Q4KL25 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lhfpl5Q4KL25 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lhfpl5Q4KL25 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lhfpl5Q4KL25 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lhfpl5Q4KL25 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lhfpl5Q4KL25 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhfpl5Q4KL25 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lhfpl5Q4KL25 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhfpl5Q4KL25 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lhfpl5Q4KL25 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms