RNA–Protein interactions for RNA: YOR143C

THI80, Transcript of Thiamine pyrophosphokinase, yeast

Gene THI80, Length 960 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THI80	YOR143C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	BUD17	P53727	317 aa		5.01	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		5	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	CDC26	P14724	124 aa		5	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	HOP1	P20050	605 aa		5	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	GPG1	P53130	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	HMG2	P12684	1045 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	MBR1	P23493	339 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	RPC34	P32910	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	LRO1	P40345	661 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	YNL018C	P53976	612 aa		4.98	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	AEP2	P22136	580 aa		4.97	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	CCL1	P37366	393 aa		4.97	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	BRN1	P38170	754 aa		4.97	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	APD1	P38281	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	YJL193W	P39542	402 aa		4.97	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	PIP2	P52960	996 aa		4.97	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	YGL081W	P53156	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	ARR3	Q06598	404 aa		4.97	□□□□□ -1.61
THI80	YOR143C	MRPL9	P31334	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	MTC7	P32633	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	EHT1	P38295	451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	OPT1	P40897	799 aa		4.96	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	GAT1	P43574	510 aa		4.96	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
THI80	YOR143C	RMP1	Q12530	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	SEC12	P11655	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	VPS33	P20795	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	ATP23	P53722	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	SKY1	Q03656	742 aa		4.95	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	HXT4	P32467	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	YJL043W	P47053	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	YDL183C	P48569	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	PEF1	P53238	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	PEA2	P40091	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	SAP4	P53036	818 aa		4.93	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	USA1	Q03714	838 aa		4.93	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	RGT2	Q12300	763 aa		4.93	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	TSR4	P25040	408 aa		4.92	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	BEM3	P32873	1128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	MDR1	P53258	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	DOS2	P54858	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	STP1	Q00947	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	VPS5	Q92331	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THI80	YOR143C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	BET2	P20133	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	CWH43	P25618	953 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	DSS4	P32601	143 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	SNO3	P43544	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	YFL015C	P43578	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	WAR1	Q03631	944 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	AAC1	P04710	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	PCK1	P10963	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	EXO1	P39875	702 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	YEL076C	P39971	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	NMD5	P46970	1048 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	CRT10	Q08226	957 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	ATP12	P22135	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	GSY2	P27472	705 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	YPT10	P38146	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	SPC105	P53148	917 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	MPS1	P54199	764 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	TRE2	Q08693	809 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	DAL3	P32459	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	EMP65	P40085	556 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	YIL092W	P40497	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	TDA10	P42938	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	IRC5	P43610	853 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	SLD3	P53135	668 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	BSP1	Q06604	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	CBP3	P21560	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	FRE7	Q12333	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	BI2	P03873	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	UBP12	P39538	1254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THI80	YOR143C	NIT2	P47016	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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