RNA–Protein interactions for RNA: YOL080C

REX4, Transcript of Putative RNA exonuclease, yeast

Gene REX4, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REX4	YOL080C	IOC4	Q04213	475 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	LRO1	P40345	661 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	FMP30	Q02883	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	ARR3	Q06598	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	PLP2	Q12017	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	TFC4	P33339	1025 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	YGL117W	P53133	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	SLD3	P53135	668 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	ULA1	Q12059	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	PCK1	P10963	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	CNE1	P27825	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	RIM4	P38741	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	PIH1	P38768	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	PEF1	P53238	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	BUD17	P53727	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	FOL1	P53848	824 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	ARG7	Q04728	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	THI7	Q05998	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	OSW1	Q08692	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	VPS34	P22543	875 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	CPR8	P53728	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.86	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	KAR1	P11927	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	HOP1	P20050	605 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	VPS33	P20795	691 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	AAD3	P25612	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	PLC1	P32383	869 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	TOM20	P35180	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	PAF1	P38351	445 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	YJL193W	P39542	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	PEX14	P53112	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	COQ11	Q05892	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	VPS5	Q92331	675 aa		4.85	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	TAX4	P47030	604 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	MNT2	P53059	558 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	MDR1	P53258	950 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	PEX15	Q08215	383 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	MDM10	P18409	493 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	ARG1	P22768	420 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	CWH43	P25618	953 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	EMP65	P40085	556 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	YNL018C	P53976	612 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	PHM6	Q05637	104 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	URA3	P03962	267 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	ERG11	P10614	530 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	MRC1	P25588	1096 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	ORC2	P32833	620 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	STL1	P39932	569 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	COQ6	P53318	479 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	HOL1	P53389	586 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	SEC12	P11655	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	PMA2	P19657	947 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	DSS4	P32601	143 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	CCL1	P37366	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	MAD2	P40958	196 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	USA1	Q03714	838 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	HOF1	Q05080	669 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	LOT5	P34234	306 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	YPT10	P38146	199 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	YIL092W	P40497	633 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	PIP2	P52960	996 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	SAP4	P53036	818 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	YNR071C	P53757	342 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	TGS1	Q12052	315 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	DIN7	Q12086	430 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	SLX4	Q12098	748 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	HOS1	Q12214	470 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	WHI2	P12611	486 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
REX4	YOL080C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	BET2	P20133	325 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	NUP1	P20676	1076 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REX4	YOL080C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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