RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	EHT1	P38295	451 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	YEL025C	P39991	1188 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	YDL183C	P48569	320 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	BUD17	P53727	317 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	YDL073W	Q07454	984 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	YAP7	Q08182	245 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	YPL216W	Q08964	1102 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	PTP1	P25044	335 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	XBP1	P40489	647 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	ATG36	P46983	293 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	COQ6	P53318	479 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	YNL018C	P53976	612 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	ARR3	Q06598	404 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	HMG2	P12684	1045 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	HOP1	P20050	605 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	DGR2	P32330	852 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	GRX7	P38068	203 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	LRO1	P40345	661 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	FOL1	P53848	824 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.24	□□□□□ -1.57	not detected
MGR3	YMR115W	WHI2	P12611	486 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	HXT4	P32467	576 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	NET1	P47035	1189 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	YOL057W	Q08225	711 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	MRC1	P25588	1096 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	DAL3	P32459	195 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	SEC5	P89102	971 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	TMA17	Q12513	150 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	ATP12	P22135	325 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	TGS1	Q12052	315 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MGR3	YMR115W	LOT5	P34234	306 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	PAF1	P38351	445 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	AQY1	P0CD91	305 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	VPS33	P20795	691 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	CCL1	P37366	393 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	YPT10	P38146	199 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	YJL193W	P39542	402 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	GAT1	P43574	510 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	YJR120W	P47157	116 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	SAP4	P53036	818 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	USA1	Q03714	838 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	RPC34	P32910	317 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	SKY1	Q03656	742 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	ORM2	Q06144	216 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	YPR027C	Q12079	277 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	FRE7	Q12333	620 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	TOP1	P04786	769 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	YFL015C	P43578	164 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	PEF1	P53238	335 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	RMP1	Q12530	201 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	EXO1	P39875	702 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	YJL043W	P47053	257 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	ATP23	P53722	227 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	AEP2	P22136	580 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	TPM2	P40414	161 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	IRC3	Q06683	689 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	YLR464W	P0CX17	216 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	BEM3	P32873	1128 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	YEL076C	P39971	216 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	IRC5	P43610	853 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	RGT2	Q12300	763 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	PCK1	P10963	549 aa		5.15	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	MRPL9	P31334	269 aa		5.15	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	DSS4	P32601	143 aa		5.15	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	PEA2	P40091	420 aa		5.15	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	TRE2	Q08693	809 aa		5.15	□□□□□ -1.58
MGR3	YMR115W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.15	□□□□□ -1.58	not detected
MGR3	YMR115W	EUG1	P32474	517 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MGR3	YMR115W	APD1	P38281	316 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MGR3	YMR115W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
MGR3	YMR115W	PEX8	P53248	589 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MGR3	YMR115W	STP1	Q00947	519 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MGR3	YMR115W	WAR1	Q03631	944 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MGR3	YMR115W	CWH43	P25618	953 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MGR3	YMR115W	OPT1	P40897	799 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MGR3	YMR115W	BST1	P43571	1029 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MGR3	YMR115W	NIT2	P47016	307 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MGR3	YMR115W	YOR378W	Q08902	515 aa		5.13	□□□□□ -1.59

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