RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	HOP1	P20050	605 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	YMC1	P32331	307 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	PIH1	P38768	344 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	EAF5	P39995	279 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	LRO1	P40345	661 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	BUD17	P53727	317 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	ARR3	Q06598	404 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	YOR378W	Q08902	515 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	ULA1	Q12059	462 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	VPS5	Q92331	675 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	VPS33	P20795	691 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	CWH43	P25618	953 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	CNE1	P27825	502 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	PLC1	P32383	869 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	RIM4	P38741	713 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	YJL193W	P39542	402 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	MDR1	P53258	950 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	HOL1	P53389	586 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	FOL1	P53848	824 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	YML122C	Q03207	126 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	PHM6	Q05637	104 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	YDL073W	Q07454	984 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	VPS34	P22543	875 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	LOT5	P34234	306 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	STL1	P39932	569 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	MNT2	P53059	558 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	YGL117W	P53133	265 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	CPR8	P53728	308 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	FMP30	Q02883	468 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	COQ11	Q05892	277 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	TGS1	Q12052	315 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	ZPS1	Q12512	249 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	PCK1	P10963	549 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	SEC12	P11655	471 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	COQ6	P53318	479 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	ARG7	Q04728	441 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	AAD3	P25612	363 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	DSS4	P32601	143 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	CCL1	P37366	393 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	YNL018C	P53976	612 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	USA1	Q03714	838 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	OSW1	Q08692	278 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	SLX4	Q12098	748 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	HOS1	Q12214	470 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CSE4	YKL049C	URA3	P03962	267 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	WHI2	P12611	486 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	ARG1	P22768	420 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	ORC2	P32833	620 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	YIL092W	P40497	633 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	ATG36	P46983	293 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	SAP4	P53036	818 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	THI7	Q05998	598 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	PSF3	Q12146	194 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	PMA2	P19657	947 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	PHO3	P24031	467 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	MAD2	P40958	196 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	YNR071C	P53757	342 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	HOF1	Q05080	669 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	ERG11	P10614	530 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	BET2	P20133	325 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	YPT10	P38146	199 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	TAX4	P47030	604 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	NUR1	Q12066	484 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	DIN7	Q12086	430 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	TGL1	P34163	548 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	HOT13	P36078	116 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	SAW1	P39735	261 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	GSM1	P42950	618 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	YNL034W	P53963	612 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	AAC1	P04710	309 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	CBP3	P21560	335 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	MRPL9	P31334	269 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	SDS22	P36047	338 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	SDH8	P38345	138 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	STB5	P38699	743 aa		3.48	□□□□□ -1.85

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