RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	HOP1	P20050	605 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NEM1	YHR004C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
NEM1	YHR004C	YIL092W	P40497	633 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NEM1	YHR004C	OSW7	P43611	510 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NEM1	YHR004C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
NEM1	YHR004C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
NEM1	YHR004C	MGM1	P32266	881 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	WAR1	Q03631	944 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	IOC4	Q04213	475 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	YLR001C	Q07895	862 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	GCS1	P35197	352 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	CCL1	P37366	393 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	TPO3	Q06451	622 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	TDA10	P42938	290 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	SAP4	P53036	818 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	YNL193W	P53870	558 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	YLR111W	Q12528	110 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	BI2	P03873	423 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	PRM2	P40534	656 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	HER1	Q12276	1246 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	CDS1	P38221	457 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	YIL024C	P40543	189 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	CKB2	P38930	258 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	MGS1	P40151	587 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	CFD1	P40558	293 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	YPL071C	Q02864	156 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	TFB2	Q02939	513 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	USA1	Q03714	838 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	YMR085W	P0CF18	432 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	OCA5	P38738	679 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	YAT2	P40017	923 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	IES1	P43579	692 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	YOR111W	Q99210	232 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEM1	YHR004C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	YPT10	P38146	199 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	LRO1	P40345	661 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	IRC7	P43623	340 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	SAE2	P46946	345 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	YNL058C	P53947	316 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	ARR3	Q06598	404 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	YCG1	Q06680	1035 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	BUD7	Q08754	746 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	SEC65	P29478	273 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	AAC1	P04710	309 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	YHR033W	P38690	423 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	MAF1	P41910	395 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
NEM1	YHR004C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	SFP1	P32432	683 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	EHT1	P38295	451 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	YJL193W	P39542	402 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	YGR153W	P48238	217 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	HRD3	Q05787	833 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	SRL1	Q08673	210 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NEM1	YHR004C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
NEM1	YHR004C	CRT10	Q08226	957 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	TOP1	P04786	769 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	VPS33	P20795	691 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	ATO2	P32907	282 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	FLO5	P38894	1075 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	YJR096W	P47137	282 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	SNA4	Q07549	140 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	PCL8	Q08966	492 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	HMG2	P12684	1045 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	BET2	P20133	325 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	COQ3	P27680	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	YDL183C	P48569	320 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	SEC12	P11655	471 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	MTC7	P32633	139 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	MTG2	P38860	518 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	YEL076C	P39971	216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	BOP3	P53958	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	YHM2	Q04013	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	OAF3	P36023	863 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	HXT7	P39004	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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