RNA–Protein interactions for RNA: YCL050C

APA1, Transcript of AP4A phosphorylase, yeast

Gene APA1, Length 966 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APA1	YCL050C	PEF1	P53238	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	HOL1	P53389	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	ULA1	Q12059	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	YMC1	P32331	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	YJL193W	P39542	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	LRO1	P40345	661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	IRC5	P43610	853 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	YDL183C	P48569	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	PEX14	P53112	341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	BUD17	P53727	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	COG6	P53959	839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	COQ11	Q05892	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	PEX15	Q08215	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	VPS5	Q92331	675 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	CNE1	P27825	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	ORC2	P32833	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	TFC4	P33339	1025 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	LOT5	P34234	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	PAF1	P38351	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	CPR8	P53728	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	ARR3	Q06598	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	TGS1	Q12052	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	PCK1	P10963	549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	HOP1	P20050	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	VPS33	P20795	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	MRC1	P25588	1096 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	CWH43	P25618	953 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	EAF5	P39995	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	YGL117W	P53133	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	FOL1	P53848	824 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	STL1	P39932	569 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	PHM6	Q05637	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	THI7	Q05998	598 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	HOS1	Q12214	470 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	AAD3	P25612	363 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	PLC1	P32383	869 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	MNT2	P53059	558 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	COQ6	P53318	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APA1	YCL050C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	ERG11	P10614	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	WHI2	P12611	486 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	BET2	P20133	325 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	DSS4	P32601	143 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	CCL1	P37366	393 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	ARG7	Q04728	441 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	OSW1	Q08692	278 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	TAX4	P47030	604 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	YNL018C	P53976	612 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	USA1	Q03714	838 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	HOF1	Q05080	669 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	SLX4	Q12098	748 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	PSF3	Q12146	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	PMA2	P19657	947 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	ARG1	P22768	420 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	MRPL9	P31334	269 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	YIL092W	P40497	633 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	URA3	P03962	267 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	NUP1	P20676	1076 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	SAP4	P53036	818 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	MDM10	P18409	493 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	PHO3	P24031	467 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	HOT13	P36078	116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	SAW1	P39735	261 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	MAD2	P40958	196 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	YJL043W	P47053	257 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	YNR071C	P53757	342 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	RIM13	Q03792	727 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	SEG1	Q04279	960 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	NUR1	Q12066	484 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APA1	YCL050C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
APA1	YCL050C	RPC34	P32910	317 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APA1	YCL050C	SDS22	P36047	338 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APA1	YCL050C	TAF5	P38129	798 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APA1	YCL050C	OPT1	P40897	799 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APA1	YCL050C	WAR1	Q03631	944 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APA1	YCL050C	ORM2	Q06144	216 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APA1	YCL050C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
APA1	YCL050C	AAC1	P04710	309 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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