RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623171.1

TMEM5-208, Transcript of UDP-D-xylose:ribitol-5-phosphate beta1,4-xylosyltransferase, human

Gene TMEM5, Length 4,531 nt, Biotype TEC, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM5-208	ENST00000623171	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171		H3BQV1	296 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	ERLIN2	O94905	339 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	GSDMD	P57764	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	TMF1	P82094	1093 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	PLCB3	Q01970	1234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	MAF1	Q9H063	256 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	KANK1	Q14678	1352 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	KIF3B	O15066	747 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	C21orf2	O43822	256 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	KATNA1	O75449	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	OAT	P04181	439 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	CCND1	P24385	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	TCIRG1	Q13488	830 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	ICMT	O60725	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	PDC	P20941	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	NEK3	P51956	506 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	JAML	Q86YT9	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	AGL	P35573	1532 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	MAN1A1	P33908	653 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	SOX11	P35716	441 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	FANCC	Q00597	558 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	PAK2	Q13177	524 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	ERO1A	Q96HE7	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	SYCE3	A1L190	88 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	TMEM127	O75204	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	TIPRL	O75663	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	AMPD3	Q01432	767 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	NEDD9	Q14511	834 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	PADI6	Q6TGC4	694 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	HLA-C	Q95604	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	PANK3	Q9H999	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	RERE	Q9P2R6	1566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	PIK3C2B	O00750	1634 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	MYOM2	P54296	1465 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	TBX3	O15119	743 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	BCAR3	O75815	825 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM5-208	ENST00000623171	MPST	P25325	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms