RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600953.3

LINC01435-211, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1435, humanhuman

TSL 5

Gene LINC01435, Length 634 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01435-211ENST00000600953 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC01435-211ENST00000600953 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC01435-211ENST00000600953 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC01435-211ENST00000600953 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC01435-211ENST00000600953 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC01435-211ENST00000600953 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC01435-211ENST00000600953 IGHA2P01877 340 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC01435-211ENST00000600953 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
LINC01435-211ENST00000600953 GATA6Q92908 595 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC01435-211ENST00000600953 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
LINC01435-211ENST00000600953 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC01435-211ENST00000600953 NPHS2Q9NP85 383 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC01435-211ENST00000600953 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC01435-211ENST00000600953 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC01435-211ENST00000600953 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 FAM170BA6NMN3 283 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 NFICP08651 508 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 COL19A1Q14993 1142 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 LGR6Q9HBX8 967 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 PIM2Q9P1W9 311 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 GPR182O15218 404 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 ADH5P11766 374 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 IRAK1P51617 712 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 USP11P51784 963 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 POU4F3Q15319 338 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 FAM129BQ96TA1 746 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 MTMR7Q9Y216 660 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 GRIN2AQ12879 1464 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 WNT11O96014 354 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 GRIK1P39086 918 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 FAAP100Q0VG06 881 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 MSMPQ1L6U9 139 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 ZNF576Q9H609 170 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 SHROOM2Q13796 1616 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 ADCY10Q96PN6 1610 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 MAPKBP1O60336 1514 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 PI16Q6UXB8 463 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 DYMQ7RTS9 669 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 ABI1Q8IZP0 508 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 EHD4Q9H223 541 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 ATG3Q9NT62 314 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 WDR97A6NE52 1622 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 LIG1P18858 919 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 RAB6AP20340 208 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 ITPKAP23677 461 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 ZAR1Q86SH2 424 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 ABCB6Q9NP58 842 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 B3GALT4O96024 378 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 FOSL1P15407 271 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 PAOXQ6QHF9 649 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 WDR18Q9BV38 432 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 CUX1P39880 1505 aa6.46□□□□□ -1.37
LINC01435-211ENST00000600953 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC01435-211ENST00000600953 AOC2O75106 756 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC01435-211ENST00000600953 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC01435-211ENST00000600953 STK35Q8TDR2 534 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC01435-211ENST00000600953 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC01435-211ENST00000600953 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
LINC01435-211ENST00000600953 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC01435-211ENST00000600953 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LINC01435-211ENST00000600953 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LINC01435-211ENST00000600953 NUP160Q12769 1436 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms