RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	TRIM17	Q9Y577	477 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	PTPRF	P10586	1907 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	SRGAP3	O43295	1099 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	INPP5B	P32019	993 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	RASGRF1	Q13972	1273 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	CCL15	Q16663	113 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	MAST3	O60307	1309 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	UNCX	A6NJT0	531 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	ALDH1A1	P00352	501 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	PI16	Q6UXB8	463 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM83A	Q86UY5	434 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF384	Q8TF68	577 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	MRI	Q9BWK5	157 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	FBXO3	Q9UK99	471 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A1B0GUL7	405 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	INHBE	P58166	350 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	XAGE2	Q96GT9	111 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	DOCK1	Q14185	1865 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	SIPA1L1	O43166	1804 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	IRF6	O14896	467 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	MTX1	Q13505	466 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	CSAD	Q9Y600	493 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM151A	Q8WW52	585 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	USP40	Q9NVE5	1235 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	BTBD19	C9JJ37	291 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	GAK	O14976	1311 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	MGAM	O43451	1857 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	POTEF	A5A3E0	1075 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	GNAI3	P08754	354 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	RGS3	P49796	1198 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	GTF2A2	P52657	109 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	ABCF2	Q9UG63	623 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	RLBP1	P12271	317 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	SP3	Q02447	781 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	ERO1B	Q86YB8	467 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-231	ENST00000600201	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	SEMA3E	O15041	775 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	GNAI2	P04899	355 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	CTGF	P29279	349 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	PPIL2	Q13356	520 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	MOGS	Q13724	837 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	ERO1A	Q96HE7	468 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	BTD	P43251	543 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	MECOM	Q03112	1051 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	PICALM	Q13492	652 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	DCAF15	Q66K64	600 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	EFCC1	Q9HA90	598 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM196B	A6NMK8	535 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	MCAM	P43121	646 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53

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