RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567594.1

SSSCA1-AS1-201, Transcript of SSSCA1 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

BASIC

Gene SSSCA1-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.32■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FKBP1CQ5VVH2 108 aa28.32■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SDSP20132 328 aa28.31■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 BTDP43251 543 aa28.31■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.31■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 APPBP2Q92624 585 aa28.31■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CLEC11AQ9Y240 323 aa28.31■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MYH2Q9UKX2 1941 aa28.3■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 KIF3CO14782 793 aa28.3■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TNFAIP1Q13829 316 aa28.3■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 USP40Q9NVE5 1235 aa28.29■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa28.28■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.28■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NPM3O75607 178 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TNNI2P48788 182 aa28.27■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa28.27■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ADGRA1Q86SQ6 560 aa28.27■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SKAP1Q86WV1 359 aa28.27■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 HELLSQ9NRZ9 838 aa28.27■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GGA3Q9NZ52 723 aa28.27■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.27■■■□□ 2.12
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MYH7P12883 1935 aa28.26■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TOMM70O94826 608 aa28.26■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 AIDAQ96BJ3 306 aa28.26■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa28.26■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RHBDL3P58872 404 aa28.25■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CHADLQ6NUI6 762 aa28.25■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.25■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SULF1Q8IWU6 871 aa28.25■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MIGA1Q8NAN2 632 aa28.25■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 IDI2Q9BXS1 227 aa28.25■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa28.25■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa28.24■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FAM83AQ86UY5 434 aa28.24■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 VEZTQ9HBM0 779 aa28.24■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ECM29Q5VYK3 1845 aa28.23■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CLRN2A0PK11 232 aa28.23■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TEX11Q8IYF3 940 aa28.23■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SMC1BQ8NDV3 1235 aa28.23■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.23■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ENTPD3O75355 529 aa28.22■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GNAT2P19087 354 aa28.22■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 OSBP2Q969R2 916 aa28.22■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MBD4O95243 580 aa28.21■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 POTEIP0CG38 1075 aa28.21■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 POTEJP0CG39 1038 aa28.21■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa28.21■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.21■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 AK9Q5TCS8 1911 aa28.2■■■□□ 2.11
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FSTL1Q12841 308 aa28.2■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CASC1Q6TDU7 716 aa28.2■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FAM151AQ8WW52 585 aa28.19■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.19■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.19■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.19■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.18■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GPAA1O43292 621 aa28.18■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CHGBP05060 677 aa28.18■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CHMLP26374 656 aa28.18■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SLFNL1Q499Z3 407 aa28.18■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 LCORLQ8N3X6 602 aa28.18■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ARMT1Q9H993 441 aa28.18■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RAD50Q92878 1312 aa28.18■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 USP5P45974 858 aa28.17■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RASA3Q14644 834 aa28.17■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 HOOK2Q96ED9 719 aa28.17■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.16■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 USP48Q86UV5 1035 aa28.16■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa28.16■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FAM227BQ96M60 508 aa28.16■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.16■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 A0A0D9SFI3 127 aa28.15■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 M0R2C6 588 aa28.15■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CDC45O75419 566 aa28.15■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CACNB3P54284 484 aa28.15■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NFIAQ12857 509 aa28.15■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.15■■■□□ 2.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms