RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 CEP44Q9C0F1 390 aa6.79□□□□□ -1.32
GDE1-202ENST00000563645 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.79□□□□□ -1.32
GDE1-202ENST00000563645 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.78□□□□□ -1.32
GDE1-202ENST00000563645 USP17L7P0C7H9 530 aa6.78□□□□□ -1.32
GDE1-202ENST00000563645 LIG1P18858 919 aa6.78□□□□□ -1.32
GDE1-202ENST00000563645 NME2P22392 152 aa6.78□□□□□ -1.32
GDE1-202ENST00000563645 GNA15P30679 374 aa6.78□□□□□ -1.32
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GDE1-202ENST00000563645 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
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GDE1-202ENST00000563645 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
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GDE1-202ENST00000563645 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.78□□□□□ -1.32
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GDE1-202ENST00000563645 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.72□□□□□ -1.33
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GDE1-202ENST00000563645 ERCC3P19447 782 aa6.71□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 ADMP35318 185 aa6.71□□□□□ -1.34
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GDE1-202ENST00000563645 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.71□□□□□ -1.34
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GDE1-202ENST00000563645 NBPF11Q86T75 865 aa6.71□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.71□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.71□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 DISC1Q9NRI5 854 aa6.71□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 PIM2Q9P1W9 311 aa6.71□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 PARP2Q9UGN5 583 aa6.71□□□□□ -1.34
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