RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	PFKFB1	P16118	471 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	FGFR2	P21802	821 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	KRT40	Q6A162	431 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	NUP98	P52948	1817 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	NEDD4	P46934	1319 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559		B4E1Z4	1266 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	KCND1	Q9NSA2	647 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	BTG4	Q9NY30	223 aa		21.32	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		21.31	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA5	Q8NB90	893 aa		21.31	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD7	Q92527	254 aa		21.31	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		21.31	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		21.31	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	DISP2	A7MBM2	1401 aa		21.31	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087WWV3	80 aa		21.31	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		21.31	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		21.31	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	WASF1	Q92558	559 aa		21.31	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	NAPB	Q9H115	298 aa		21.31	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	STK36	Q9NRP7	1315 aa		21.3	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	LRP5	O75197	1615 aa		21.3	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		21.3	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	21.3	■■□□□ 1	4e-6	■■□□□ 13.2
RRN3-205	ENST00000563559	SYK	P43405	635 aa		21.3	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	CEP135	Q66GS9	1140 aa		21.3	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	MICU3	Q86XE3	530 aa		21.3	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	KRT23	Q9C075	422 aa		21.3	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	LY9	Q9HBG7	655 aa		21.3	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		21.3	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	IKBKB	O14920	756 aa		21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	FBXW7	Q969H0	707 aa		21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	GNAT2	P19087	354 aa		21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	CDC27	P30260	824 aa		21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	CCZ1B	P86790	482 aa		21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	NTRK3	Q16288	839 aa		21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	HPSE	Q9Y251	543 aa		21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	NRDC	O43847	1150 aa		21.28	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	PTPN14	Q15678	1187 aa		21.28	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		21.28	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		21.28	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	ARID5B	Q14865	1188 aa		21.28	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	PHKB	Q93100	1093 aa		21.28	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		21.28	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	MTA3	Q9BTC8	594 aa		21.28	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		21.28	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		21.28	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	EXOC5	O00471	708 aa		21.27	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	PTPA	Q15257	358 aa		21.27	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		21.27	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF11	Q86T75	865 aa		21.27	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		21.27	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	AIFM3	Q96NN9	605 aa		21.27	■■□□□ 1
RRN3-205	ENST00000563559	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		21.27	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	NID2	Q14112	1375 aa		21.26	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		21.26	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	FAM177B	A6PVY3	158 aa		21.26	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	CUTA	O60888	179 aa		21.26	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	SMC2	O95347	1197 aa		21.26	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		21.26	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K14	Q99558	947 aa		21.26	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	MBD4	O95243	580 aa		21.26	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	RXRA	P19793	462 aa		21.26	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	RASGRF1	Q13972	1273 aa		21.26	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	RESP18	Q5W5W9	173 aa		21.26	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		21.26	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		21.26	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	DOCK2	Q92608	1830 aa		21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	BIN1	O00499	593 aa		21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	MYO1B	O43795	1136 aa		21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	IFNAR1	P17181	557 aa		21.25	■□□□□ 0.99

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